77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2332 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 283 aa  564  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  58.42 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  58.06 
 
 		 285 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  33.04 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  31.7 
 
 		 508 aa  82.8  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  30.4 
 
 		 596 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  26.77 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  30.8 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  29.13 
 
 		 521 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  32.86 
 
 		 505 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  27.62 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  28.34 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  32.73 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  28.36 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  29.75 
 
 		 512 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  29.75 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  28.34 
 
 		 511 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  23.87 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  28.57 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  26.73 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  27.15 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  28.52 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  26.81 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  22.53 
 
 		 338 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  28.28 
 
 		 721 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  30.04 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  28.76 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  27.7 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  28.02 
 
 		 719 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  31.25 
 
 		 505 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  23.66 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  28.43 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  26.94 
 
 		 519 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  25.86 
 
 		 522 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  23.17 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  24.68 
 
 		 523 aa  52.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  27.56 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  26.98 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  25.9 
 
 		 331 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  28.1 
 
 		 511 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  25.53 
 
 		 333 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  24.56 
 
 		 524 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  25.94 
 
 		 499 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  24.38 
 
 		 519 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  25.31 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  28.94 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  25.98 
 
 		 920 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  44 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  26.75 
 
 		 508 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  27.14 
 
 		 510 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  39.19 
 
 		 309 aa  48.9  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  42.37 
 
 		 510 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  35.63 
 
 		 636 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  28.29 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  36.67 
 
 		 543 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  29.36 
 
 		 520 aa  46.6  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  39.71 
 
 		 347 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  28.31 
 
 		 540 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  28.31 
 
 		 540 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  26.32 
 
 		 508 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  28.31 
 
 		 540 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  27.35 
 
 		 510 aa  46.6  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  49.15 
 
 		 545 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  27.39 
 
 		 505 aa  45.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  26.07 
 
 		 329 aa  45.8  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  41.82 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  24.35 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  44.9 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  28.09 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  27.31 
 
 		 512 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  27.52 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  40 
 
 		 518 aa  43.9  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  29.35 
 
 		 492 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  38.81 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  26.38 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2560  hypothetical protein  39.66 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  27.09 
 
 		 527 aa  42  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>