58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1934 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  100 
 
 
272 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  38.38 
 
 
492 aa  129  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  38.95 
 
 
495 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  37.36 
 
 
510 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  35.79 
 
 
512 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  38.46 
 
 
522 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  34.25 
 
 
598 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  34.93 
 
 
519 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  32.59 
 
 
527 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  34.36 
 
 
502 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  33.98 
 
 
517 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  34.36 
 
 
502 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  34.36 
 
 
502 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  36.15 
 
 
513 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  32.62 
 
 
496 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  36.08 
 
 
509 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  33.21 
 
 
492 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  31.43 
 
 
505 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  31.09 
 
 
539 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  33.33 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  32.79 
 
 
520 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  30.07 
 
 
523 aa  65.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  30.12 
 
 
494 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  35.71 
 
 
544 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  31.34 
 
 
508 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  26.04 
 
 
318 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  29.92 
 
 
504 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  30.88 
 
 
508 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  30 
 
 
920 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  32.04 
 
 
258 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  29.68 
 
 
291 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  31.16 
 
 
329 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  29.73 
 
 
540 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  29.73 
 
 
540 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  29.73 
 
 
540 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  31.27 
 
 
588 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  35.59 
 
 
510 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  33.49 
 
 
265 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  29.3 
 
 
545 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  32.08 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  26.72 
 
 
364 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  28.98 
 
 
329 aa  49.7  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  29.07 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  30 
 
 
545 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  30.26 
 
 
511 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  27.78 
 
 
505 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  24.52 
 
 
333 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  28.76 
 
 
508 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  24.02 
 
 
519 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  29.62 
 
 
543 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  26.46 
 
 
310 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  29.06 
 
 
721 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  24.9 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  30.45 
 
 
719 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  28.47 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.57 
 
 
511 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  27.45 
 
 
510 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  28.7 
 
 
328 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>