100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6577 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  100 
 
 
512 aa  997    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  66.67 
 
 
522 aa  615  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  46.98 
 
 
519 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  45.09 
 
 
495 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  43.03 
 
 
510 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  42.77 
 
 
492 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  41.1 
 
 
505 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  40.51 
 
 
527 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  36.88 
 
 
539 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  39.14 
 
 
544 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  39.53 
 
 
490 aa  239  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  39.8 
 
 
513 aa  232  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  36.95 
 
 
496 aa  229  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  39.05 
 
 
502 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  39.05 
 
 
502 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  39.05 
 
 
502 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  37.8 
 
 
517 aa  223  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  38.26 
 
 
492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  36.27 
 
 
509 aa  213  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5198  CHAD domain containing protein  37.23 
 
 
526 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  43.51 
 
 
598 aa  169  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  32.08 
 
 
523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  35.79 
 
 
272 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  28.98 
 
 
596 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  31.73 
 
 
721 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  30.91 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  23.55 
 
 
519 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  27.8 
 
 
318 aa  65.1  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  27.44 
 
 
508 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  29.33 
 
 
534 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  29.46 
 
 
494 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  31.02 
 
 
358 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  28.91 
 
 
504 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.13 
 
 
521 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  27.17 
 
 
511 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  30.43 
 
 
719 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  25.93 
 
 
511 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  25.96 
 
 
330 aa  60.1  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  29.92 
 
 
512 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  29.92 
 
 
512 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  28.47 
 
 
543 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  27.36 
 
 
512 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  27.17 
 
 
310 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  29.48 
 
 
328 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  27.33 
 
 
513 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  26.56 
 
 
322 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  25.38 
 
 
523 aa  57  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  30.23 
 
 
510 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  32.3 
 
 
540 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  32.3 
 
 
540 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  25.72 
 
 
510 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  32.3 
 
 
540 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  23.97 
 
 
558 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  28.69 
 
 
327 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  26.16 
 
 
920 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  24.13 
 
 
555 aa  55.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  30.4 
 
 
508 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  29.96 
 
 
508 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  22.09 
 
 
338 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  28.87 
 
 
489 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  28.87 
 
 
489 aa  51.6  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  26 
 
 
329 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  29.84 
 
 
588 aa  50.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  30.8 
 
 
545 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  31.09 
 
 
545 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  27.59 
 
 
499 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  29.95 
 
 
329 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  27.1 
 
 
514 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3911  CHAD domain-containing protein  22.71 
 
 
289 aa  49.3  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  23.54 
 
 
519 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  23.42 
 
 
333 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  26.13 
 
 
292 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  26.24 
 
 
523 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  26.86 
 
 
291 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16960  hypothetical protein  35.17 
 
 
326 aa  47.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.365163  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  22.87 
 
 
297 aa  47.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  25.93 
 
 
292 aa  47.4  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  29.65 
 
 
490 aa  47  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  25.79 
 
 
487 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  27.52 
 
 
518 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  28.83 
 
 
509 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  26.17 
 
 
293 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  27.31 
 
 
344 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  29.34 
 
 
543 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  26.13 
 
 
297 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  26.39 
 
 
304 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  27.44 
 
 
364 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  27.94 
 
 
286 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  29.93 
 
 
512 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  27.35 
 
 
505 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  32.89 
 
 
636 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  27.14 
 
 
688 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  26.2 
 
 
494 aa  44.3  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  26.42 
 
 
439 aa  44.3  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  27.14 
 
 
640 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  26.51 
 
 
505 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  27.14 
 
 
640 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  27.14 
 
 
640 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  31.28 
 
 
691 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  31.28 
 
 
649 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>