84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2978 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  100 
 
 		 344 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  78.09 
 
 		 286 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  57.89 
 
 		 285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  35.98 
 
 		 291 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  31.85 
 
 		 265 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  33.07 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  33.96 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  33.67 
 
 		 487 aa  79.7  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  31.6 
 
 		 277 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  30.89 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  35.56 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  30.29 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  32.16 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  28.04 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  33.19 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  33.19 
 
 		 508 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  30.36 
 
 		 499 aa  67.8  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  26.94 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  30.92 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  34.07 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  28.96 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  29.82 
 
 		 508 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  25.95 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  30.09 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  30.47 
 
 		 540 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  30.47 
 
 		 540 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  30.47 
 
 		 540 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  24.59 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  32.76 
 
 		 577 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  29.84 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  26.69 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  30.99 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  30.69 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  31.22 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  27.19 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  31.22 
 
 		 640 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  33.8 
 
 		 511 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  31.22 
 
 		 640 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  31.22 
 
 		 640 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  48.39 
 
 		 920 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  28.64 
 
 		 504 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  29.11 
 
 		 558 aa  56.6  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  31.22 
 
 		 691 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  28.96 
 
 		 539 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  31.88 
 
 		 588 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  31.22 
 
 		 649 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  31.8 
 
 		 512 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  31.8 
 
 		 512 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  29.41 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  32.54 
 
 		 498 aa  52.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  30.8 
 
 		 643 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  28.57 
 
 		 721 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  30.32 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  27.08 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  29.62 
 
 		 510 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  29.05 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  29.22 
 
 		 719 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  28.77 
 
 		 522 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  25.21 
 
 		 327 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  27.53 
 
 		 494 aa  49.7  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  27.78 
 
 		 518 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  31.02 
 
 		 598 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  28.06 
 
 		 514 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  30.97 
 
 		 543 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  27.52 
 
 		 523 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  36.21 
 
 		 636 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  27.47 
 
 		 439 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  31.2 
 
 		 545 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  30.77 
 
 		 540 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  27.88 
 
 		 292 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  23.74 
 
 		 555 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  28.91 
 
 		 521 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  30.99 
 
 		 495 aa  46.2  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  30.69 
 
 		 508 aa  46.2  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  27.31 
 
 		 512 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  31.86 
 
 		 510 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  29.38 
 
 		 505 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  28.37 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  24.26 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  26.42 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  26.32 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  24.89 
 
 		 297 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  26.46 
 
 		 534 aa  42.7  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>