217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0947 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  79.33 
 
 
721 aa  1055    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  100 
 
 
719 aa  1426    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  39.93 
 
 
521 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  30.65 
 
 
920 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  27.24 
 
 
558 aa  95.9  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  27.54 
 
 
523 aa  90.5  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  35 
 
 
505 aa  87.4  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  30.23 
 
 
508 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  27.56 
 
 
519 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  31.01 
 
 
329 aa  84  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  29.9 
 
 
508 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  36.89 
 
 
512 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  33.78 
 
 
520 aa  83.2  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  28.11 
 
 
555 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  31.06 
 
 
505 aa  82.4  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  34.45 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  31.85 
 
 
596 aa  81.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  28.07 
 
 
508 aa  80.1  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  25.1 
 
 
523 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  34.03 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  28.69 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  27.31 
 
 
522 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  36.45 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  36.45 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  30.71 
 
 
487 aa  76.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  36.1 
 
 
512 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  34.26 
 
 
435 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  34.26 
 
 
435 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  30.09 
 
 
510 aa  76.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  34.26 
 
 
435 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  34.6 
 
 
513 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  29.29 
 
 
524 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  34.47 
 
 
512 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  26.05 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  31.67 
 
 
598 aa  73.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  31.53 
 
 
505 aa  73.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  33.33 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  32.74 
 
 
505 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  31.06 
 
 
309 aa  72  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  30.07 
 
 
519 aa  71.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  32.87 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  32.87 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  29.43 
 
 
539 aa  71.2  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  25.68 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  32.87 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  32.87 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  32.87 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  32.09 
 
 
433 aa  70.5  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  32.34 
 
 
433 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0458  adenylate cyclase  31.37 
 
 
211 aa  70.1  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  32.09 
 
 
433 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  33.33 
 
 
433 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  29.83 
 
 
505 aa  70.1  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  32.77 
 
 
433 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  32.53 
 
 
522 aa  69.7  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  32.26 
 
 
433 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  32.77 
 
 
433 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  32.77 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  25.8 
 
 
297 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  33.65 
 
 
492 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2542  adenylate cyclase  30.29 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  30.13 
 
 
511 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  33.1 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  32.4 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  32.4 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  32.4 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  30.43 
 
 
512 aa  67.4  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  32.58 
 
 
540 aa  67  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  31.14 
 
 
435 aa  67  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  36.84 
 
 
291 aa  66.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  32.54 
 
 
508 aa  66.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  28.21 
 
 
495 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  22.42 
 
 
338 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  25 
 
 
333 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  28.33 
 
 
534 aa  65.5  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  28.69 
 
 
510 aa  65.1  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  26.94 
 
 
514 aa  65.1  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  29.86 
 
 
494 aa  64.7  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  32.02 
 
 
208 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.15 
 
 
511 aa  65.1  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  34.1 
 
 
545 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  29.54 
 
 
505 aa  64.3  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  31.34 
 
 
499 aa  63.9  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  34.22 
 
 
543 aa  63.9  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  28.92 
 
 
518 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  33.9 
 
 
508 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  28.69 
 
 
308 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  30.56 
 
 
347 aa  63.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  28.81 
 
 
327 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  32.76 
 
 
508 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  31.39 
 
 
253 aa  62.4  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  26.16 
 
 
325 aa  61.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  33.33 
 
 
508 aa  61.2  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  28.7 
 
 
291 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  34.3 
 
 
503 aa  60.8  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  32.22 
 
 
208 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  31.76 
 
 
498 aa  60.8  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  40 
 
 
207 aa  60.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  32.89 
 
 
588 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  35.67 
 
 
208 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>