100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1766 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  100 
 
 
291 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  54.78 
 
 
293 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  55.3 
 
 
291 aa  248  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  49.09 
 
 
277 aa  228  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  39.29 
 
 
304 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  39.55 
 
 
325 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  41.77 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  33.73 
 
 
286 aa  92  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  36.74 
 
 
285 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  35.07 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  30.95 
 
 
508 aa  83.2  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  33.48 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  31.48 
 
 
511 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  31.6 
 
 
490 aa  68.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  25.27 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  28.1 
 
 
540 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  28.1 
 
 
540 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  28.1 
 
 
540 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  27.56 
 
 
505 aa  65.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  29.82 
 
 
721 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  29.32 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  29.82 
 
 
511 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  25.79 
 
 
523 aa  63.9  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  24.91 
 
 
347 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  27.13 
 
 
310 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  28.1 
 
 
545 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  30.49 
 
 
512 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  26.72 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  25.3 
 
 
519 aa  62.8  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  29.71 
 
 
588 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  29.96 
 
 
518 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  27.36 
 
 
467 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  28.15 
 
 
519 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  30.49 
 
 
512 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  26.97 
 
 
327 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  30.49 
 
 
512 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  29.46 
 
 
494 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  30.11 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  30.58 
 
 
292 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  31.12 
 
 
577 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  28.51 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  28.7 
 
 
719 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  28.22 
 
 
543 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  29.81 
 
 
364 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  32.38 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  31.12 
 
 
649 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  30.67 
 
 
492 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  31.12 
 
 
691 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  29.33 
 
 
510 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  27.44 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  28.38 
 
 
513 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  27.96 
 
 
487 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  27.31 
 
 
508 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  27.4 
 
 
558 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  24.91 
 
 
338 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  30.71 
 
 
688 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  26.48 
 
 
508 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  24.18 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  30.94 
 
 
253 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  31.12 
 
 
640 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  31.12 
 
 
640 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  25.97 
 
 
504 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  31.12 
 
 
640 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  28.81 
 
 
545 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  28.04 
 
 
495 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  26.82 
 
 
555 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  28.02 
 
 
496 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  26.83 
 
 
598 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  28.37 
 
 
523 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  31.12 
 
 
643 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  28.63 
 
 
920 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  28.44 
 
 
596 aa  52.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  24.89 
 
 
524 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  31.33 
 
 
527 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  23.6 
 
 
318 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  27.03 
 
 
510 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  23.62 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  30 
 
 
331 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  28.1 
 
 
514 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  25.79 
 
 
510 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  28.64 
 
 
358 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  27.9 
 
 
539 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  44 
 
 
283 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  29.46 
 
 
509 aa  49.3  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  28.52 
 
 
505 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  22.44 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  28.09 
 
 
517 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  30.17 
 
 
253 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  26.86 
 
 
512 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  27.92 
 
 
492 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  30.17 
 
 
490 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  25.19 
 
 
522 aa  46.6  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  25.23 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  24.88 
 
 
439 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  29.78 
 
 
522 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  27.57 
 
 
329 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  27.27 
 
 
505 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  30.84 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  31.08 
 
 
512 aa  42.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  24.6 
 
 
534 aa  42.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>