64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1320 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  632  1e-180  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  29.77 
 
 
344 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  28.3 
 
 
333 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  31.18 
 
 
322 aa  135  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  29.1 
 
 
347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  29.94 
 
 
338 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  30 
 
 
331 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  30.12 
 
 
330 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  30.86 
 
 
495 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  28.74 
 
 
920 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  28.37 
 
 
512 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  28.04 
 
 
512 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  34.55 
 
 
520 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  32.38 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  31.62 
 
 
509 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  27.91 
 
 
512 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  28.5 
 
 
490 aa  55.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  29.57 
 
 
511 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  31.84 
 
 
329 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  29.51 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  28.24 
 
 
523 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  26.56 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  26.75 
 
 
598 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2560  hypothetical protein  28.79 
 
 
296 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  28.05 
 
 
517 aa  54.3  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  32.74 
 
 
544 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  33.1 
 
 
511 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  29.79 
 
 
505 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3329  hypothetical protein  31.46 
 
 
314 aa  52.8  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062489  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  29.11 
 
 
508 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  27.68 
 
 
293 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  26.97 
 
 
487 aa  52  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  31.71 
 
 
588 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  27.54 
 
 
297 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  31.74 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  28.57 
 
 
496 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  27.03 
 
 
505 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  27.34 
 
 
721 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  24.44 
 
 
513 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  26.43 
 
 
555 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.69 
 
 
521 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  29.24 
 
 
253 aa  49.3  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  31.71 
 
 
277 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  29.76 
 
 
494 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  27.31 
 
 
504 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  32.26 
 
 
510 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  30.36 
 
 
527 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  30.45 
 
 
364 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  26.23 
 
 
719 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  27.57 
 
 
297 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  29.96 
 
 
292 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  33.33 
 
 
596 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  29.96 
 
 
285 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  25.93 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  28.01 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1575  CHAD domain containing protein  30.94 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  27.56 
 
 
540 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  27.56 
 
 
540 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  27.56 
 
 
540 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  24.88 
 
 
292 aa  43.9  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  26.36 
 
 
524 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.06 
 
 
445 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  25.33 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  27.45 
 
 
510 aa  42.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>