31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2560 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2560  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  55.56 
 
 		 305 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  48.65 
 
 		 297 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  49.49 
 
 		 297 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  36.99 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  36.11 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  33.07 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  33.03 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  29.21 
 
 		 721 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  28.25 
 
 		 920 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  26.97 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  25.29 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  27.87 
 
 		 505 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  21.89 
 
 		 636 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  26.8 
 
 		 719 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  30.69 
 
 		 521 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  27.19 
 
 		 499 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  28.29 
 
 		 364 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  25 
 
 		 318 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  23 
 
 		 523 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  29.58 
 
 		 588 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  23.66 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  29.32 
 
 		 527 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  26.46 
 
 		 505 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  25.12 
 
 		 558 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1575  CHAD domain containing protein  42.59 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  23.24 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  36.54 
 
 		 681 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  39.66 
 
 		 283 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  32.11 
 
 		 520 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1188  CHAD domain containing protein  32.69 
 
 		 313 aa  42.4  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00821021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>