51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3218 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  100 
 
 		 325 aa  645    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  86.87 
 
 		 309 aa  490  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  38.14 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  39.58 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2560  hypothetical protein  34.36 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  34.59 
 
 		 297 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  33.33 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.82 
 
 		 521 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  31.49 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  31.96 
 
 		 920 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  28.16 
 
 		 512 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  27.76 
 
 		 721 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  30.21 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  29.28 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  28.84 
 
 		 512 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  31.78 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  26.16 
 
 		 719 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  30.7 
 
 		 358 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  28.16 
 
 		 504 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  27.52 
 
 		 505 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  29.23 
 
 		 512 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  30.12 
 
 		 505 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  24.07 
 
 		 636 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  25.94 
 
 		 364 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  31.11 
 
 		 508 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  31.6 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  27.27 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  27.31 
 
 		 524 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  30.67 
 
 		 514 aa  52.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  28.96 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  28.52 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  29.36 
 
 		 596 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  28.12 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  25.28 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  28.02 
 
 		 499 aa  49.7  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.18 
 
 		 511 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0571  CHAD domain-containing protein  47.22 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  27.66 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  29.73 
 
 		 511 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  36.36 
 
 		 520 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  30.21 
 
 		 681 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  26.05 
 
 		 505 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  23.21 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  29.72 
 
 		 490 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  28.85 
 
 		 518 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  44.07 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  44.07 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  27.71 
 
 		 258 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  28.63 
 
 		 527 aa  42.7  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  34.02 
 
 		 331 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  25.11 
 
 		 523 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>