40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0879 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2560  hypothetical protein  55.56 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  44.44 
 
 		 297 aa  249  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  45.02 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  38.14 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  41.98 
 
 		 309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  33.9 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  27.43 
 
 		 534 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  27.96 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  26.3 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  27.15 
 
 		 558 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  29 
 
 		 721 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  25.09 
 
 		 521 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  25.09 
 
 		 322 aa  52.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  30.33 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  24.41 
 
 		 524 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  30.28 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  23.94 
 
 		 523 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  29.82 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  28.4 
 
 		 527 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1188  CHAD domain containing protein  27.31 
 
 		 313 aa  49.3  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00821021  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  24.68 
 
 		 920 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  28.32 
 
 		 522 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  26.7 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  24.51 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  24.64 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  27.98 
 
 		 358 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  29.31 
 
 		 719 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  24.05 
 
 		 555 aa  46.6  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  27.43 
 
 		 519 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  23.88 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  24.02 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  24.17 
 
 		 523 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  23.83 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  27.7 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  37.5 
 
 		 636 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  38.46 
 
 		 681 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  28.15 
 
 		 512 aa  43.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  29.49 
 
 		 511 aa  42.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  27.73 
 
 		 512 aa  42.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>