89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3043 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  58.95 
 
 		 286 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  57.89 
 
 		 344 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  36.74 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  31.56 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  33.17 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  31.01 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  33.96 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  32.14 
 
 		 524 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  28.8 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  33.33 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  26.09 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  31.75 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  31.88 
 
 		 364 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  31 
 
 		 293 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  33.61 
 
 		 511 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  29.32 
 
 		 558 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  31.55 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  33.95 
 
 		 540 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  33.95 
 
 		 540 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  33.95 
 
 		 540 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  29.73 
 
 		 596 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  29.3 
 
 		 555 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  28.44 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  31.78 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  33.49 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  32.13 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  32.63 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  33.64 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  30.97 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  33.81 
 
 		 545 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  29.52 
 
 		 512 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  35.27 
 
 		 543 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  32.84 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  36.19 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  34.95 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  27.94 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  30.33 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  32.59 
 
 		 508 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  27.24 
 
 		 510 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  30.77 
 
 		 920 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  31.58 
 
 		 508 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  26.94 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  29.78 
 
 		 523 aa  55.8  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  30.13 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  31.58 
 
 		 499 aa  55.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  32.72 
 
 		 588 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  31.36 
 
 		 505 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  30.67 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  29.96 
 
 		 494 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  26.74 
 
 		 505 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  27.21 
 
 		 504 aa  52.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  28.05 
 
 		 523 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  45.45 
 
 		 498 aa  52.8  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  29.06 
 
 		 508 aa  52.4  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  29.62 
 
 		 512 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  30.12 
 
 		 512 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  30.47 
 
 		 721 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  25.09 
 
 		 519 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  30.19 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  28.32 
 
 		 539 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  30.53 
 
 		 490 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  25.57 
 
 		 467 aa  50.8  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  31.51 
 
 		 511 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  33.33 
 
 		 577 aa  50.1  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  34.25 
 
 		 544 aa  49.3  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  26.95 
 
 		 534 aa  48.9  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  29.95 
 
 		 512 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  29.44 
 
 		 517 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  27.27 
 
 		 310 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  28.45 
 
 		 520 aa  46.6  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  29.84 
 
 		 514 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  33.33 
 
 		 691 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  30.49 
 
 		 539 aa  46.2  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  33.33 
 
 		 649 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  30.7 
 
 		 518 aa  45.8  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  33.33 
 
 		 640 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 640 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  33.33 
 
 		 640 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  26.53 
 
 		 521 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 688 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  22.86 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  33.92 
 
 		 598 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  27.63 
 
 		 439 aa  43.9  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  30.18 
 
 		 329 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  22.86 
 
 		 344 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  30.37 
 
 		 719 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0571  CHAD domain-containing protein  48.15 
 
 		 324 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3399  CHAD domain containing protein  28.7 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.052112 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>