89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3433 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  100 
 
 
598 aa  1152    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  39.74 
 
 
510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  36.6 
 
 
522 aa  252  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  42.86 
 
 
495 aa  180  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  43.92 
 
 
512 aa  173  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  42.51 
 
 
492 aa  152  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  36.24 
 
 
505 aa  144  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  37.92 
 
 
519 aa  140  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  37.1 
 
 
539 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  38.25 
 
 
492 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  39.7 
 
 
527 aa  134  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  41.44 
 
 
496 aa  127  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5198  CHAD domain containing protein  43.05 
 
 
526 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  36.86 
 
 
490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  38.35 
 
 
513 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  42.78 
 
 
509 aa  114  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  34.74 
 
 
517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  42.39 
 
 
502 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  42.39 
 
 
502 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  42.39 
 
 
502 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  39.25 
 
 
544 aa  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  33.03 
 
 
523 aa  106  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  33.21 
 
 
358 aa  97.4  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  31.07 
 
 
508 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  31.07 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  30.33 
 
 
543 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  28.52 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  31.87 
 
 
520 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  30.42 
 
 
310 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  26.42 
 
 
322 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  28.32 
 
 
920 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  30.56 
 
 
588 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  28.75 
 
 
596 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  34.25 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  25.19 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  28.75 
 
 
545 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  31.86 
 
 
510 aa  67  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  24.35 
 
 
330 aa  65.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  31.45 
 
 
721 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  27.94 
 
 
318 aa  63.9  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  35.29 
 
 
329 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  30.59 
 
 
510 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  29.87 
 
 
534 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  31.88 
 
 
265 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  30 
 
 
719 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  32.26 
 
 
490 aa  63.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  28.12 
 
 
543 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  26.37 
 
 
508 aa  60.1  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  30.33 
 
 
545 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  28.3 
 
 
505 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  32.61 
 
 
514 aa  58.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  24.44 
 
 
347 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  30.4 
 
 
512 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  27.82 
 
 
519 aa  57.8  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  27.95 
 
 
328 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  28.33 
 
 
327 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.24 
 
 
511 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  27.21 
 
 
291 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  28.79 
 
 
540 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  28.79 
 
 
540 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  30.37 
 
 
512 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  28.79 
 
 
540 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  29.55 
 
 
512 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  26.64 
 
 
519 aa  54.7  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  21.07 
 
 
338 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  26.75 
 
 
318 aa  54.3  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  38.67 
 
 
2449 aa  54.3  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  31.9 
 
 
494 aa  53.9  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  27.51 
 
 
513 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  26.27 
 
 
293 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  33.85 
 
 
512 aa  53.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  31 
 
 
364 aa  50.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  29.82 
 
 
509 aa  50.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  28.28 
 
 
511 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  25.65 
 
 
329 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  29 
 
 
291 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  40.98 
 
 
331 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  28.88 
 
 
521 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  28.38 
 
 
304 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  29.76 
 
 
286 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  24.22 
 
 
504 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  29.31 
 
 
518 aa  47.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  26.92 
 
 
494 aa  47.4  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  49.12 
 
 
289 aa  47  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  25 
 
 
313 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  35.29 
 
 
1888 aa  46.2  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  35 
 
 
636 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  31.02 
 
 
344 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  27.51 
 
 
308 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>