96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1269 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  100 
 
 
555 aa  1140    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  49.31 
 
 
523 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  45.68 
 
 
523 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  41.45 
 
 
524 aa  379  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  38.85 
 
 
558 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  39.84 
 
 
522 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  34.88 
 
 
517 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  36.9 
 
 
505 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  32.61 
 
 
329 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  35.62 
 
 
309 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  26.87 
 
 
487 aa  98.2  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  29.6 
 
 
721 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  30.6 
 
 
318 aa  87  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  24.75 
 
 
920 aa  80.5  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  31.51 
 
 
588 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  28.11 
 
 
719 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  26.09 
 
 
519 aa  73.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  25.52 
 
 
467 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  29.32 
 
 
540 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  29.32 
 
 
540 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  29.32 
 
 
540 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  30.21 
 
 
545 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  29.83 
 
 
543 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.92 
 
 
521 aa  70.1  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  26.79 
 
 
508 aa  68.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  30.5 
 
 
512 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  29.5 
 
 
545 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  30.5 
 
 
512 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  26.85 
 
 
292 aa  64.7  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.66 
 
 
445 aa  64.7  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  27.69 
 
 
511 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  26.8 
 
 
534 aa  63.9  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  31.12 
 
 
577 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  26.71 
 
 
504 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  29.8 
 
 
512 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  47.3 
 
 
543 aa  61.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  26.58 
 
 
513 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  27.19 
 
 
285 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  27.71 
 
 
308 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  24.33 
 
 
253 aa  58.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  24.23 
 
 
329 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  26.79 
 
 
310 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  26.34 
 
 
283 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  26.51 
 
 
286 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  27.57 
 
 
285 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  27.19 
 
 
277 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  24.69 
 
 
338 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  26.79 
 
 
364 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  26.82 
 
 
291 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  27.57 
 
 
292 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  24.13 
 
 
512 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  27.27 
 
 
327 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  23.15 
 
 
508 aa  53.9  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  29.05 
 
 
640 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  29.05 
 
 
640 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  29.05 
 
 
640 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  26.67 
 
 
519 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  27.02 
 
 
358 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  29.05 
 
 
691 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  29.05 
 
 
688 aa  53.5  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  25.27 
 
 
292 aa  52.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  29.05 
 
 
649 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  25.95 
 
 
522 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  27.84 
 
 
520 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  22.84 
 
 
508 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  26.52 
 
 
322 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  23.18 
 
 
495 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  26.01 
 
 
331 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  26.48 
 
 
527 aa  52  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  25.62 
 
 
330 aa  51.2  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  27.17 
 
 
313 aa  51.2  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  29.58 
 
 
253 aa  50.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  29.3 
 
 
505 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  26.43 
 
 
318 aa  50.4  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  28.76 
 
 
494 aa  50.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  26.32 
 
 
325 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  26.45 
 
 
510 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  28.44 
 
 
510 aa  50.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  27.68 
 
 
304 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  24.51 
 
 
539 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  23.94 
 
 
328 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  28.4 
 
 
494 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  22.73 
 
 
489 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  22.73 
 
 
489 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  26.36 
 
 
511 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  28.19 
 
 
297 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  24.35 
 
 
265 aa  47.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  41.18 
 
 
510 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0879  hypothetical protein  24.05 
 
 
305 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  22.87 
 
 
490 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  28.57 
 
 
643 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  24.2 
 
 
344 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  27.34 
 
 
490 aa  46.2  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  24.23 
 
 
596 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  25.93 
 
 
496 aa  45.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  26.52 
 
 
508 aa  43.5  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>