63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3611 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  55.51 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  29.08 
 
 		 487 aa  86.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  29.55 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  33.17 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  31.75 
 
 		 588 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  32.23 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  25.3 
 
 		 519 aa  63.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  30.38 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  31.58 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  30.41 
 
 		 540 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  30.41 
 
 		 540 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  30.41 
 
 		 540 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  30.36 
 
 		 558 aa  59.7  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  24.33 
 
 		 555 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  30.81 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  26.36 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  33.72 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  29.19 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  31.39 
 
 		 719 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  25.74 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  30.94 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  29.11 
 
 		 291 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  24.7 
 
 		 523 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  26.13 
 
 		 523 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  29.52 
 
 		 344 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  34.6 
 
 		 495 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  26.51 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  30.53 
 
 		 721 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  28.09 
 
 		 534 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  28.85 
 
 		 512 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  25.94 
 
 		 522 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  30.41 
 
 		 545 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  34.27 
 
 		 688 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  34.27 
 
 		 640 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  34.27 
 
 		 640 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  34.27 
 
 		 640 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  29.49 
 
 		 543 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  27.13 
 
 		 318 aa  52.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  28.85 
 
 		 512 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  34.27 
 
 		 691 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  28.95 
 
 		 505 aa  52.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  34.27 
 
 		 649 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  26.5 
 
 		 521 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  27.24 
 
 		 499 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  33.04 
 
 		 540 aa  49.7  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  26.11 
 
 		 524 aa  49.7  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  27.57 
 
 		 508 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  26.88 
 
 		 494 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  27.35 
 
 		 505 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  25.7 
 
 		 293 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  26.74 
 
 		 511 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  33.87 
 
 		 643 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  30.94 
 
 		 504 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  25.93 
 
 		 512 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  35.29 
 
 		 636 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  24.43 
 
 		 920 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  27.45 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  29.11 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  25.87 
 
 		 511 aa  42.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  25.41 
 
 		 467 aa  42.7  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  28.27 
 
 		 510 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  25.12 
 
 		 309 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>