56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0977 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  100 
 
 		 517 aa  1065    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  39.03 
 
 		 523 aa  352  8e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  35.42 
 
 		 555 aa  296  8e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  34.31 
 
 		 524 aa  292  9e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  36.25 
 
 		 523 aa  289  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  35.07 
 
 		 558 aa  266  5.999999999999999e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  34.02 
 
 		 522 aa  250  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  28.51 
 
 		 505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  31.25 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  27.07 
 
 		 309 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  29.8 
 
 		 920 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  28.1 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  29.24 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  25.27 
 
 		 721 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  25.76 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  25.68 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  27.8 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  25.75 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  25.17 
 
 		 719 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  24.36 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  24.73 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  25.55 
 
 		 508 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1188  CHAD domain containing protein  32.08 
 
 		 313 aa  56.6  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00821021  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  25.42 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  27.91 
 
 		 462 aa  54.7  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.14 
 
 		 521 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  25.74 
 
 		 292 aa  54.7  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  28.05 
 
 		 318 aa  54.3  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  27.87 
 
 		 545 aa  53.9  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  24.39 
 
 		 527 aa  53.5  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  26.45 
 
 		 490 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  23.78 
 
 		 504 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  26.97 
 
 		 540 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  26.97 
 
 		 540 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  26.97 
 
 		 540 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  24.89 
 
 		 318 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  28.02 
 
 		 253 aa  50.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  24.6 
 
 		 513 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  25.24 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  25.89 
 
 		 534 aa  48.5  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  28.09 
 
 		 291 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  23.47 
 
 		 543 aa  48.5  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  27.75 
 
 		 277 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  26.14 
 
 		 364 aa  47.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  25.24 
 
 		 292 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  25.2 
 
 		 322 aa  47.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  25.1 
 
 		 292 aa  47.4  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  26.43 
 
 		 543 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  25.99 
 
 		 545 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  24.35 
 
 		 492 aa  47  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  27.53 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  27.67 
 
 		 285 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  26.89 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  26.02 
 
 		 588 aa  44.3  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  28.15 
 
 		 338 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  26.75 
 
 		 292 aa  43.5  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>