114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3671 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  86.08 
 
 
545 aa  885    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  100 
 
 
540 aa  1064    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  83.12 
 
 
543 aa  827    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  100 
 
 
540 aa  1064    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  73.02 
 
 
588 aa  790    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  100 
 
 
540 aa  1064    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  81.8 
 
 
545 aa  816    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  54.94 
 
 
577 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  60.85 
 
 
640 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  60.85 
 
 
640 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  60.85 
 
 
640 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  60.85 
 
 
688 aa  395  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  59.65 
 
 
691 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  58.54 
 
 
649 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  60.15 
 
 
643 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  36.42 
 
 
508 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  36.09 
 
 
508 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  35.02 
 
 
510 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  35.48 
 
 
487 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  27.19 
 
 
519 aa  98.6  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  30.83 
 
 
508 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  30.77 
 
 
543 aa  93.2  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  32.78 
 
 
511 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  31.76 
 
 
511 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  36.61 
 
 
596 aa  91.3  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  30.74 
 
 
318 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  28.93 
 
 
499 aa  87  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  28.64 
 
 
505 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  25.88 
 
 
519 aa  84.7  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  31.75 
 
 
513 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  32.49 
 
 
504 aa  83.6  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  33.08 
 
 
265 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  33.67 
 
 
490 aa  78.2  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  28.41 
 
 
494 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  30.4 
 
 
505 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  36.51 
 
 
490 aa  74.7  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  32.68 
 
 
495 aa  74.3  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  31.58 
 
 
509 aa  73.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  29.53 
 
 
510 aa  73.9  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  29.67 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  29.32 
 
 
555 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  28.82 
 
 
523 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  33.64 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  29.13 
 
 
920 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  34.91 
 
 
313 aa  69.3  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  28.94 
 
 
508 aa  67.8  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  29.51 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  29.24 
 
 
512 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  31.67 
 
 
539 aa  67.4  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  29.88 
 
 
521 aa  67.4  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  31.42 
 
 
496 aa  67  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  28.1 
 
 
291 aa  67  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  34.98 
 
 
540 aa  67  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  28.97 
 
 
329 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  28.92 
 
 
333 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  30.93 
 
 
328 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  32.06 
 
 
494 aa  65.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  30.51 
 
 
558 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  27.85 
 
 
512 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  29.33 
 
 
520 aa  65.1  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  31.46 
 
 
327 aa  63.9  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  29.41 
 
 
325 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  28.57 
 
 
512 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  28.63 
 
 
292 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  32.4 
 
 
719 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  29.07 
 
 
285 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  30.88 
 
 
329 aa  62  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  32.33 
 
 
721 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  30.43 
 
 
291 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  30.41 
 
 
253 aa  60.8  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  28.23 
 
 
511 aa  60.8  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  30.74 
 
 
518 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  29.38 
 
 
277 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  33.46 
 
 
498 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  29.67 
 
 
293 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  30.47 
 
 
524 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  26.7 
 
 
505 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  32.07 
 
 
358 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  26.78 
 
 
523 aa  58.9  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  25.89 
 
 
522 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  36.55 
 
 
512 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  26.84 
 
 
331 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  32.66 
 
 
286 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  33.18 
 
 
285 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  30.59 
 
 
492 aa  57.4  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  29.95 
 
 
514 aa  57  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  27.31 
 
 
309 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  33.58 
 
 
512 aa  56.6  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  26.09 
 
 
344 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  28.25 
 
 
598 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  32.3 
 
 
512 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1245  CHAD domain containing protein  33.04 
 
 
227 aa  55.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  30.55 
 
 
492 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  32.82 
 
 
522 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  29.17 
 
 
308 aa  53.9  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  34.16 
 
 
520 aa  53.9  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  34.04 
 
 
519 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  26.38 
 
 
510 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  26.97 
 
 
517 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  25.78 
 
 
347 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>