112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6785 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  100 
 
 
519 aa  1018    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  48.18 
 
 
522 aa  371  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  46.34 
 
 
512 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  40.92 
 
 
492 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  39.03 
 
 
510 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  39.72 
 
 
495 aa  276  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  40 
 
 
517 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  40.28 
 
 
527 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  40.12 
 
 
509 aa  253  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  37.92 
 
 
505 aa  243  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  38.43 
 
 
496 aa  236  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  36.54 
 
 
513 aa  231  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  36.68 
 
 
539 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  37.27 
 
 
502 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  38.83 
 
 
492 aa  228  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  37.27 
 
 
502 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  37.27 
 
 
502 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  37.21 
 
 
544 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5198  CHAD domain containing protein  35.94 
 
 
526 aa  219  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  36.86 
 
 
490 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  37.92 
 
 
598 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  29.38 
 
 
523 aa  93.2  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  34.93 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  30.29 
 
 
721 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  29.29 
 
 
511 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  29.51 
 
 
520 aa  75.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  31.09 
 
 
596 aa  75.1  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  30.07 
 
 
719 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  29.07 
 
 
511 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  27 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  32.56 
 
 
534 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  26.9 
 
 
513 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  28.04 
 
 
508 aa  68.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  26.33 
 
 
522 aa  67  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  26.06 
 
 
521 aa  67  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  31.72 
 
 
358 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  28.62 
 
 
329 aa  63.9  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  35.04 
 
 
545 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  28.15 
 
 
291 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  28.34 
 
 
523 aa  63.5  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  32.63 
 
 
540 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  32.63 
 
 
540 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  32.63 
 
 
540 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  33.33 
 
 
543 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  24.61 
 
 
518 aa  61.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  27.21 
 
 
333 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  25.37 
 
 
523 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  27.01 
 
 
504 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  25.66 
 
 
322 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  31.82 
 
 
588 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  26.67 
 
 
555 aa  57.4  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  31.44 
 
 
545 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  30 
 
 
558 aa  56.6  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  24.63 
 
 
519 aa  55.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  32.03 
 
 
490 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  32.58 
 
 
510 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  27.18 
 
 
512 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  27.12 
 
 
293 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  28.4 
 
 
329 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  24.64 
 
 
920 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  26.23 
 
 
499 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  25 
 
 
309 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  27.1 
 
 
291 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  24.9 
 
 
519 aa  52  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  29.13 
 
 
508 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  26.31 
 
 
508 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  26.1 
 
 
512 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  32.91 
 
 
577 aa  50.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  25.7 
 
 
518 aa  50.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  29.48 
 
 
494 aa  50.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  26.12 
 
 
487 aa  50.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  26.88 
 
 
505 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  27.23 
 
 
524 aa  50.1  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  28.45 
 
 
505 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  26.1 
 
 
512 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  30.98 
 
 
286 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  33.19 
 
 
691 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  22.43 
 
 
292 aa  48.9  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  26.24 
 
 
505 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  28.4 
 
 
297 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  27.75 
 
 
467 aa  49.3  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  25.82 
 
 
318 aa  48.5  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  33.19 
 
 
649 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  24.81 
 
 
347 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  30.81 
 
 
512 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  28.32 
 
 
309 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  33.05 
 
 
688 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  30.84 
 
 
510 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4897  CHAD domain-containing protein  22.49 
 
 
338 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  26.4 
 
 
277 aa  47.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  33.05 
 
 
640 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  33.05 
 
 
640 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  33.05 
 
 
640 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  28.83 
 
 
308 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  24.15 
 
 
344 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  25.86 
 
 
297 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  26.27 
 
 
304 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  30.14 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16960  hypothetical protein  33.45 
 
 
326 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.365163  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  27.36 
 
 
517 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>