60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3334 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3396  CHAD domain-containing protein  100 
 
 
502 aa  995    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.500584 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  71.23 
 
 
517 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  68.68 
 
 
509 aa  635    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3334  CHAD domain-containing protein  100 
 
 
502 aa  995    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179861  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3345  CHAD domain-containing protein  100 
 
 
502 aa  995    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.531773  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12255  hypothetical protein  64.93 
 
 
513 aa  617  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.608135  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  42.71 
 
 
492 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  42.12 
 
 
495 aa  266  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  39.79 
 
 
505 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  38.93 
 
 
510 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  39.26 
 
 
512 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  39.58 
 
 
496 aa  243  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  36 
 
 
539 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  38.29 
 
 
527 aa  236  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  38.08 
 
 
519 aa  229  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  37.84 
 
 
490 aa  221  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  37.25 
 
 
522 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  38.81 
 
 
492 aa  206  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  34.38 
 
 
544 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5198  CHAD domain containing protein  33.65 
 
 
526 aa  146  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  38.17 
 
 
598 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  36.54 
 
 
272 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  28.51 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  30.81 
 
 
523 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  30.45 
 
 
508 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  31.09 
 
 
721 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  31.09 
 
 
719 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  32.63 
 
 
512 aa  63.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  25.44 
 
 
521 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  29.89 
 
 
508 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  27.27 
 
 
329 aa  60.5  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  26.58 
 
 
504 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  22.57 
 
 
523 aa  60.1  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  28.29 
 
 
467 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  29.76 
 
 
358 aa  57.4  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  26.47 
 
 
558 aa  57  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  31.1 
 
 
545 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  31.88 
 
 
588 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  29.73 
 
 
543 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  27.7 
 
 
304 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  25.05 
 
 
487 aa  50.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  23.08 
 
 
322 aa  50.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  30.77 
 
 
540 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  30.77 
 
 
540 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  30.77 
 
 
540 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  29.27 
 
 
329 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16960  hypothetical protein  28.63 
 
 
326 aa  48.5  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.365163  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  28.52 
 
 
510 aa  47.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  24.9 
 
 
318 aa  47.8  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  29.46 
 
 
545 aa  47.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  26.41 
 
 
291 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  27.31 
 
 
511 aa  47  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  28.02 
 
 
534 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  22.89 
 
 
519 aa  46.2  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  26.93 
 
 
511 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  23.62 
 
 
330 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  25.17 
 
 
505 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  24.4 
 
 
333 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  33.05 
 
 
518 aa  44.3  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  28.96 
 
 
555 aa  43.5  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>