101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4651 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4651  CHAD  100 
 
 		 329 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  45.15 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  47.02 
 
 		 310 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  49.06 
 
 		 328 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  37.93 
 
 		 511 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  36.33 
 
 		 512 aa  142  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  36.66 
 
 		 512 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  36.33 
 
 		 512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  35.16 
 
 		 513 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  40.91 
 
 		 494 aa  132  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  33.01 
 
 		 505 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  36.47 
 
 		 511 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  36.18 
 
 		 490 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  33.73 
 
 		 510 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  35.71 
 
 		 508 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  33.55 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  35.34 
 
 		 508 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  32.8 
 
 		 508 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  31.54 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  31.56 
 
 		 543 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  30.92 
 
 		 494 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  33.07 
 
 		 596 aa  96.3  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  34.47 
 
 		 510 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  33.88 
 
 		 514 aa  89  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  34.16 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  31.56 
 
 		 691 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  30.72 
 
 		 649 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  30.03 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  31.64 
 
 		 688 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  31.64 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  31.64 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  31.64 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  28.88 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  34.76 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  28.79 
 
 		 519 aa  75.9  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2570  CHAD domain-contain protein  31.18 
 
 		 643 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  33.16 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  30.16 
 
 		 588 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  31.07 
 
 		 545 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  30.39 
 
 		 544 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  31.1 
 
 		 543 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  29.17 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  32.32 
 
 		 492 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  28.64 
 
 		 308 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  28.97 
 
 		 540 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  28.97 
 
 		 540 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  28.97 
 
 		 540 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  29.32 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  30.83 
 
 		 545 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  28.57 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  24.71 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  35.29 
 
 		 598 aa  63.2  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  28.62 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  30.61 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  26.21 
 
 		 920 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  27.73 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2933  CHAD domain-containing protein  33.48 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  30.1 
 
 		 539 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  27.57 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  24.23 
 
 		 555 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  29.3 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  26.1 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  27.71 
 
 		 527 aa  57.4  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0215  conserved hypothetical protein; putative adenylate cyclase domain  31.61 
 
 		 523 aa  56.6  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15904  hitchhiker  0.00638587 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  27.98 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  29.31 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1934  CHAD domain containing protein  31.16 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8613  hypothetical protein  31.03 
 
 		 492 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  30.63 
 
 		 540 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  28.62 
 
 		 509 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  23.38 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  27.57 
 
 		 505 aa  53.1  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  29.05 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  28.44 
 
 		 490 aa  53.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  24.9 
 
 		 523 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  30.04 
 
 		 520 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  21.45 
 
 		 519 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  27.92 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  27.08 
 
 		 721 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  24.31 
 
 		 522 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  25 
 
 		 523 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  28.46 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  31.11 
 
 		 512 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  26.75 
 
 		 344 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  28.4 
 
 		 519 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  28.03 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  23.81 
 
 		 524 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0259  CHAD  27.85 
 
 		 522 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.822007 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  27.82 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  23.68 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  27.04 
 
 		 534 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  24.61 
 
 		 498 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  26.7 
 
 		 558 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  21.93 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  22.94 
 
 		 467 aa  44.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  24.69 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2900  CHAD domain-containing protein  31.69 
 
 		 509 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  22.35 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  25.32 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  26.78 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>