79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2764 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2764  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.538661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6748  CHAD domain containing protein  70.72 
 
 		 325 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  37.63 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4307  CHAD domain containing protein  38.51 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.948471  normal  0.595233 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0637  hypothetical protein  39.46 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  41.77 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  42.13 
 
 		 277 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  29.88 
 
 		 487 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3457  hypothetical protein  29.72 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  34.23 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  28 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  29.29 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  30.67 
 
 		 511 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  31.8 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  28.91 
 
 		 512 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  28.91 
 
 		 512 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2978  CHAD domain containing protein  29.05 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000170033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  28.64 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  29.08 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  29.88 
 
 		 508 aa  65.9  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  28.4 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  34.55 
 
 		 508 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  33.33 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  30.64 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  31.71 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  28.45 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  28.64 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  27.27 
 
 		 511 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  29.03 
 
 		 524 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  28.75 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  27.71 
 
 		 555 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  27.94 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  27.51 
 
 		 523 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  25.37 
 
 		 721 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  30.88 
 
 		 505 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  27.72 
 
 		 510 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  27.23 
 
 		 519 aa  55.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  28.57 
 
 		 558 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  28.69 
 
 		 719 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3611  hypothetical protein  26.51 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  31.02 
 
 		 545 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  29.17 
 
 		 540 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  27.49 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  29.17 
 
 		 540 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  30.38 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  29.17 
 
 		 540 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  28.37 
 
 		 523 aa  52.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  29.73 
 
 		 588 aa  52.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  23.97 
 
 		 462 aa  52.4  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  27.57 
 
 		 543 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  25.28 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  29.63 
 
 		 545 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  28.25 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  26.94 
 
 		 510 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  25.1 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  31 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  26.46 
 
 		 920 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  26.1 
 
 		 344 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  26.58 
 
 		 522 aa  48.9  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  26.85 
 
 		 514 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  24.31 
 
 		 534 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0341  CHAD  23.58 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391817  normal  0.212706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  28.14 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  30.05 
 
 		 495 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  28.27 
 
 		 358 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  26.15 
 
 		 596 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6785  CHAD domain-containing protein  27.85 
 
 		 519 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  30.33 
 
 		 509 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  25.1 
 
 		 505 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  29.83 
 
 		 508 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  27.51 
 
 		 598 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  29.55 
 
 		 467 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  28.23 
 
 		 439 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  30.38 
 
 		 544 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  37.88 
 
 		 510 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3092  CHAD domain containing protein  26.21 
 
 		 496 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0279278  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  46.3 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  47.73 
 
 		 636 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1978  CHAD domain containing protein  29.41 
 
 		 331 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.457057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>