42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2473 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2473  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  24.59 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  22.26 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  32.83 
 
 		 490 aa  68.9  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  28.36 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  29.1 
 
 		 511 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  27.36 
 
 		 596 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  26.22 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  27.11 
 
 		 508 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  26.24 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  26.05 
 
 		 513 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  28.71 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  27.65 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  26.03 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  25.84 
 
 		 558 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  29.46 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  25.3 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  26.7 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4894  CHAD domain containing protein  27.6 
 
 		 510 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  25.3 
 
 		 522 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  29.09 
 
 		 512 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  23.43 
 
 		 543 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  28.64 
 
 		 512 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  29.3 
 
 		 512 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  25.79 
 
 		 527 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  29.71 
 
 		 494 aa  48.9  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  26.41 
 
 		 523 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  28.89 
 
 		 514 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2332  CHAD domain-containing protein  25 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  28.07 
 
 		 505 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  24.89 
 
 		 523 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  25.94 
 
 		 494 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  28.37 
 
 		 511 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3433  CHAD domain containing protein  49.12 
 
 		 598 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.478083  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  26.76 
 
 		 519 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  25.23 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  23.68 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0261  CHAD domain containing protein  35.9 
 
 		 544 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4305  CHAD domain containing protein  26.17 
 
 		 358 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.926882 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  27.18 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  24.32 
 
 		 285 aa  42.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  34.62 
 
 		 495 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>