131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2672 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  987    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  49.8 
 
 		 508 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  49.61 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  49.61 
 
 		 508 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  49.61 
 
 		 498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  49.02 
 
 		 508 aa  444  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  47.85 
 
 		 503 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  47.66 
 
 		 503 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  46.64 
 
 		 503 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  46.88 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  46.76 
 
 		 503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  44.71 
 
 		 494 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  45.94 
 
 		 500 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  44.35 
 
 		 495 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  43.03 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  48.89 
 
 		 321 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  34.42 
 
 		 505 aa  253  5.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  32.95 
 
 		 505 aa  230  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  31.41 
 
 		 510 aa  223  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  31.48 
 
 		 529 aa  220  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  31.43 
 
 		 502 aa  196  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  35.46 
 
 		 495 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  42.14 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  27.68 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  40 
 
 		 433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  47.98 
 
 		 435 aa  183  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  47.98 
 
 		 435 aa  183  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  47.98 
 
 		 435 aa  183  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  43.72 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  42.91 
 
 		 443 aa  180  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  43.65 
 
 		 445 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  40.78 
 
 		 433 aa  179  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  40.78 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  41.98 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  41.98 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  41.98 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  41.98 
 
 		 433 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  44.9 
 
 		 435 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  43.62 
 
 		 433 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  41.98 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  43.21 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  43.21 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  43.21 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  43.21 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0798  adenylate cyclase  43.97 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  42.8 
 
 		 433 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  42.44 
 
 		 347 aa  140  4.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4196  putative adenylate cyclase  39.33 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  40.51 
 
 		 510 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  35.74 
 
 		 512 aa  118  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  35.12 
 
 		 315 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  34.65 
 
 		 512 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  35.64 
 
 		 286 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  35.2 
 
 		 512 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  33.97 
 
 		 505 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  38.46 
 
 		 213 aa  106  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  38.46 
 
 		 213 aa  106  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  38.46 
 
 		 213 aa  106  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  38.46 
 
 		 213 aa  106  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  38.69 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  38.69 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  37.98 
 
 		 213 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  36.65 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  40.7 
 
 		 215 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  29.43 
 
 		 494 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  40.7 
 
 		 215 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  38.28 
 
 		 499 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  34.26 
 
 		 490 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  40.2 
 
 		 291 aa  100  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  31.27 
 
 		 487 aa  99  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  37.98 
 
 		 213 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  35.68 
 
 		 508 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  35.89 
 
 		 208 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  25.6 
 
 		 519 aa  94.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  35.07 
 
 		 505 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  30.32 
 
 		 510 aa  94.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  37.09 
 
 		 540 aa  94.4  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  39.55 
 
 		 207 aa  94  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  38.82 
 
 		 208 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  38.82 
 
 		 208 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  35.58 
 
 		 514 aa  94  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  37.65 
 
 		 211 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  37.89 
 
 		 454 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  36.87 
 
 		 219 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  33.73 
 
 		 513 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  35.94 
 
 		 511 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  38.14 
 
 		 543 aa  90.1  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  31.16 
 
 		 508 aa  90.1  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  28.73 
 
 		 596 aa  87.4  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  31.69 
 
 		 508 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  37.43 
 
 		 208 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  35.71 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3027  adenylate cyclase  36.36 
 
 		 206 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0441666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3617  adenylate cyclase  38.73 
 
 		 208 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0322  adenylate cyclase  38.53 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3128  adenylate cyclase  35.02 
 
 		 219 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.352745  normal  0.54028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  34.12 
 
 		 721 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  28.76 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2542  adenylate cyclase  33.85 
 
 		 328 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5247  adenylate cyclase  42.86 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>