30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0467 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0467  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  536  1e-151  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  22.81 
 
 
721 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  24.43 
 
 
364 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3218  CHAD domain containing protein  25.45 
 
 
325 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0448482  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1188  CHAD domain containing protein  26.54 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00821021  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  21.82 
 
 
588 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  21.27 
 
 
540 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  21.27 
 
 
540 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  23.38 
 
 
508 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  21.27 
 
 
540 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  20.74 
 
 
512 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  22.07 
 
 
719 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  22.94 
 
 
508 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1045  CHAD domain containing protein  22.73 
 
 
309 aa  48.9  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0153594 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  22.48 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1455  CHAD domain-containing protein  24.46 
 
 
534 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365733  normal  0.116656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  20.39 
 
 
495 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1199  hypothetical protein  25 
 
 
920 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  20.37 
 
 
545 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  21.59 
 
 
545 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2640  CHAD domain-containing protein  51.06 
 
 
297 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  25.94 
 
 
558 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3605  CHAD domain-containing protein  23.61 
 
 
517 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673296  normal  0.196907 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  20.35 
 
 
543 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  32.05 
 
 
543 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  25.45 
 
 
523 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  21.83 
 
 
330 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  23.77 
 
 
522 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0051  CHAD domain containing protein  19.25 
 
 
527 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2569  CHAD domain-containing protein  46.81 
 
 
297 aa  42  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>