26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2447 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2447  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 258 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2251  hypothetical protein  50.61 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2056  CHAD  51.02 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000461934  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4025  CHAD  53.88 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  48.41 
 
 		 253 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22940  CHAD domain-containing protein  53.41 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.660754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2307  CHAD domain containing protein  51.98 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3462  CHAD domain-containing protein  52.38 
 
 		 259 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1909  CHAD domain-containing protein  50 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  hitchhiker  0.00000249861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1749  CHAD domain-containing protein  52.42 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000731598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  41.15 
 
 		 258 aa  164  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26940  hypothetical protein  47.15 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2282  hypothetical protein  49.35 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  30.58 
 
 		 329 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1491  CHAD domain containing protein  28.93 
 
 		 490 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143999  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  29.9 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  33.76 
 
 		 518 aa  45.8  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  30.62 
 
 		 521 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1214  CHAD domain containing protein  23.67 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  29.03 
 
 		 596 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  26.54 
 
 		 524 aa  43.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  31.49 
 
 		 539 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2103  CHAD domain containing protein  30.04 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38393 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  35.63 
 
 		 522 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3613  CHAD domain-containing protein  30.68 
 
 		 330 aa  42  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  46.88 
 
 		 512 aa  42  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>