21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2251 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2251  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2056  CHAD  90.51 
 
 		 253 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000461934  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4025  CHAD  60.08 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1909  CHAD domain-containing protein  53.78 
 
 		 259 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  hitchhiker  0.00000249861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2307  CHAD domain containing protein  54.18 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3462  CHAD domain-containing protein  53.78 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1749  CHAD domain-containing protein  54.98 
 
 		 259 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000731598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2447  CHAD domain-containing protein  50.61 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  45.16 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  44.44 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26940  hypothetical protein  42.86 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22940  CHAD domain-containing protein  46.96 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.660754  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2282  hypothetical protein  42.46 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  31.28 
 
 		 524 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  27.5 
 
 		 523 aa  45.4  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3618  CHAD domain containing protein  26.14 
 
 		 344 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1188  CHAD domain containing protein  25.67 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00821021  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000059  hypothetical protein  27.27 
 
 		 309 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.480452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  25.85 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  28.34 
 
 		 318 aa  43.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2490  CHAD domain containing protein  25.73 
 
 		 347 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>