34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2282 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2282  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26940  hypothetical protein  89.45 
 
 		 256 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2056  CHAD  44.44 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000461934  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  44.8 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4025  CHAD  47.79 
 
 		 255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2251  hypothetical protein  42.46 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  40.39 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2307  CHAD domain containing protein  45.28 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22940  CHAD domain-containing protein  49.19 
 
 		 251 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.660754  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2447  CHAD domain-containing protein  47.79 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3462  CHAD domain-containing protein  45.67 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1909  CHAD domain-containing protein  44.88 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  hitchhiker  0.00000249861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1749  CHAD domain-containing protein  45.85 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000731598 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  28.97 
 
 		 524 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1269  CHAD domain containing protein  28.64 
 
 		 555 aa  52.4  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  25.85 
 
 		 558 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  27.83 
 
 		 517 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  27.85 
 
 		 523 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  34.1 
 
 		 490 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  29.33 
 
 		 522 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1919  hypothetical protein  31.53 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  29.63 
 
 		 364 aa  45.4  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.83 
 
 		 521 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  28.91 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1673  CHAD domain-contain protein  27.44 
 
 		 467 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.8 
 
 		 445 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  50 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0947  CHAD domain-containing protein  28.57 
 
 		 719 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2718  CHAD domain containing protein  25.33 
 
 		 333 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.962724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3586  CHAD domain-containing protein  29.41 
 
 		 721 aa  42  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0072  CHAD domain-containing protein  43.1 
 
 		 505 aa  42  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1766  CHAD domain-containing protein  29.55 
 
 		 291 aa  42  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.697095 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  27.23 
 
 		 523 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  33.02 
 
 		 495 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>