22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1749 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1749  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000731598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2307  CHAD domain containing protein  83.01 
 
 		 259 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1909  CHAD domain-containing protein  83.4 
 
 		 259 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  hitchhiker  0.00000249861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3462  CHAD domain-containing protein  83.4 
 
 		 259 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2251  hypothetical protein  54.98 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2056  CHAD  52.99 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000461934  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4025  CHAD  58 
 
 		 255 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2447  CHAD domain-containing protein  52.42 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  46.18 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22940  CHAD domain-containing protein  49.39 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.660754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  43.95 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26940  hypothetical protein  45.06 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2282  hypothetical protein  45.85 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  30.09 
 
 		 508 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1320  hypothetical protein  30.86 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1188  CHAD domain containing protein  29.47 
 
 		 313 aa  46.2  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00821021  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  27.31 
 
 		 524 aa  45.4  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0977  hypothetical protein  26.5 
 
 		 517 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.25 
 
 		 445 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  30.24 
 
 		 364 aa  42.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  30.6 
 
 		 518 aa  42  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  41.51 
 
 		 523 aa  42  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>