23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3462 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3462  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2307  CHAD domain containing protein  98.46 
 
 		 259 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1909  CHAD domain-containing protein  92.16 
 
 		 259 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  hitchhiker  0.00000249861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1749  CHAD domain-containing protein  83.4 
 
 		 259 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000731598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4025  CHAD  60.89 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2251  hypothetical protein  53.78 
 
 		 253 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.624022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2056  CHAD  53.78 
 
 		 253 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000461934  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17860  CHAD domain superfamily protein  46.18 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2447  CHAD domain-containing protein  52.02 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0419057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22940  CHAD domain-containing protein  51.16 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.660754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13200  hypothetical protein  45.29 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.580154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2282  hypothetical protein  45.67 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26940  hypothetical protein  44.49 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1006  hypothetical protein  28.57 
 
 		 524 aa  49.7  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.079275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3325  CHAD domain containing protein  29.25 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000007321  normal  0.186572 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3986  CHAD domain-containing protein  29.82 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000415563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1030  CHAD domain containing protein  27.62 
 
 		 558 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1698  CHAD domain containing protein  38.46 
 
 		 523 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.94723  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3043  hypothetical protein  32.38 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1301  CHAD domain containing protein  34.88 
 
 		 522 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3177  hypothetical protein  32.24 
 
 		 364 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0591  CHAD domain containing protein  26.75 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2803  CHAD domain containing protein  29.66 
 
 		 539 aa  42.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0335686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>