199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5774 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  100 
 
 		 548 aa  1088    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  98.7 
 
 		 551 aa  762    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  58.05 
 
 		 533 aa  561  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  58.56 
 
 		 526 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  57.5 
 
 		 529 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  57.14 
 
 		 533 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  59.64 
 
 		 534 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  64.23 
 
 		 541 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  63.14 
 
 		 540 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  67.69 
 
 		 533 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  50 
 
 		 550 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  29.45 
 
 		 521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2280  Sporulation domain protein  30.49 
 
 		 499 aa  89.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  28.07 
 
 		 525 aa  88.6  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2684  triosephosphate isomerase  24.58 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.882617  normal  0.208617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  28.46 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  30.65 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  30.24 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  30.24 
 
 		 274 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  25.33 
 
 		 532 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  38.71 
 
 		 506 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  30.24 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  25.7 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  31.19 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  28.18 
 
 		 549 aa  67.4  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  31.98 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  30.28 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  31.66 
 
 		 281 aa  66.6  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  29.63 
 
 		 266 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  27.82 
 
 		 563 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  30.28 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  29.8 
 
 		 261 aa  65.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  30.28 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  30.28 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  30.28 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  30.28 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  25.57 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  29.8 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  28.57 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  26.8 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  26.59 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.94 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  30.45 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  32.52 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  25.61 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  30.36 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  27.57 
 
 		 338 aa  63.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  28.86 
 
 		 310 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  28.86 
 
 		 309 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  28.86 
 
 		 309 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.6 
 
 		 562 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  26.32 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  28.11 
 
 		 563 aa  62.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  30.45 
 
 		 266 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00252  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshM (pilus type IV)  26.96 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  31.22 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  30 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  25.83 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  31.39 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  27.98 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.29 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  28.63 
 
 		 831 aa  60.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  28.28 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  22.67 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  30.85 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  28.8 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  28.92 
 
 		 329 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  32.18 
 
 		 616 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  25.47 
 
 		 491 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  28.92 
 
 		 329 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  24.76 
 
 		 439 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.21 
 
 		 587 aa  60.1  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  28.92 
 
 		 329 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  26.98 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  29.85 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  32.67 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  29.44 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.63 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1803  phage tail X family protein  24.41 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  26.64 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  28.63 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  29.06 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  26.7 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  24.58 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  27.51 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  29.8 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0996  hypothetical protein  26.38 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3743  general secretion pathway protein-related protein  31.25 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.122195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  29.82 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.41 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  28.81 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  23.21 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.48 
 
 		 589 aa  57.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  32.12 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  32.12 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.55 
 
 		 556 aa  57  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  25.93 
 
 		 554 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  29.86 
 
 		 302 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.93 
 
 		 562 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  29.86 
 
 		 302 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>