54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0325 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  100 
 
 		 428 aa  855    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  98.83 
 
 		 428 aa  846    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  98.36 
 
 		 425 aa  746    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  96.99 
 
 		 432 aa  697    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  98.6 
 
 		 428 aa  844    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  98.83 
 
 		 428 aa  846    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  98.6 
 
 		 428 aa  844    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  98.83 
 
 		 428 aa  844    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  99.3 
 
 		 428 aa  850    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  77.57 
 
 		 425 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  77.57 
 
 		 425 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  77.12 
 
 		 425 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  77.35 
 
 		 425 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  77.35 
 
 		 425 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  64.64 
 
 		 426 aa  468  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  38.6 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  36.95 
 
 		 336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  36.3 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  37.44 
 
 		 350 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  42.31 
 
 		 340 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  40.6 
 
 		 329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  40.6 
 
 		 329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  40.6 
 
 		 329 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  27.75 
 
 		 521 aa  67.4  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  31.64 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2684  triosephosphate isomerase  36.59 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.882617  normal  0.208617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  35.71 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  31.58 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  31.58 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  35.56 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  34.83 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  36.05 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  27.78 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  31.43 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1354  hypothetical protein  32.26 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0537927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  29.79 
 
 		 616 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  30.77 
 
 		 526 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  32.58 
 
 		 497 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  29.47 
 
 		 533 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  29.76 
 
 		 550 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  30 
 
 		 534 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  30 
 
 		 529 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0833  sporulation domain-containing protein  47.5 
 
 		 491 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.210508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  29.27 
 
 		 540 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  29.27 
 
 		 541 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0640  putative lipoprotein, may be involved in cell division  30.77 
 
 		 185 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0255277  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  24.74 
 
 		 548 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0664  hypothetical protein  27.5 
 
 		 491 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.564671  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  23.71 
 
 		 551 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0104  sporulation domain-containing protein  28.05 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0165  sporulation domain-containing protein  35.62 
 
 		 311 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  30 
 
 		 616 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1062  Sporulation domain protein  28.95 
 
 		 308 aa  43.9  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000155  DamX-related protein  30.38 
 
 		 189 aa  43.5  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.678183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>