174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0410 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  95.93 
 
 		 541 aa  897    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  100 
 
 		 540 aa  1073    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  72.03 
 
 		 533 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  68.38 
 
 		 526 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  67.88 
 
 		 529 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  67.75 
 
 		 533 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  66.61 
 
 		 534 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  64.06 
 
 		 548 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  64.06 
 
 		 551 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  60.88 
 
 		 533 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  49.65 
 
 		 550 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  27.94 
 
 		 521 aa  176  7e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  27.65 
 
 		 525 aa  94  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  30.16 
 
 		 323 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  28.62 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  31.36 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2280  Sporulation domain protein  28.91 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  43.01 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  40.74 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  40.74 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  40.74 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  28.66 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  28.69 
 
 		 532 aa  67  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  25.95 
 
 		 549 aa  66.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  30.12 
 
 		 274 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  22.44 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  29.32 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  29.32 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1303  type II secretory pathway ATPase ExeA  24.15 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  34.73 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  28.51 
 
 		 301 aa  63.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  33.55 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  32.69 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  38.6 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  32.69 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  32.69 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  36.84 
 
 		 506 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  26.36 
 
 		 261 aa  62  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  32.69 
 
 		 428 aa  62  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  29.93 
 
 		 304 aa  62  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  26.85 
 
 		 261 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  32.69 
 
 		 428 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  26.89 
 
 		 306 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  26.89 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0996  hypothetical protein  23.95 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  33.93 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  27.16 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0965  hypothetical protein  23.35 
 
 		 483 aa  60.1  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  27.67 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  28.46 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0104  sporulation domain-containing protein  25.56 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  26.56 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  24.33 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  25.64 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1925  putative ATPase  27.98 
 
 		 749 aa  58.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.118483  hitchhiker  0.0000000000629978 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  25.93 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  29.11 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  29.11 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  29.11 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  28.12 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  28.12 
 
 		 309 aa  57  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  28.12 
 
 		 309 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0833  sporulation domain-containing protein  26.45 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.210508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  23.83 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3743  general secretion pathway protein-related protein  28.63 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.122195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  26.64 
 
 		 267 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  27.34 
 
 		 310 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  24.54 
 
 		 338 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  26.73 
 
 		 282 aa  55.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  21.4 
 
 		 505 aa  55.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4945  general secretion pathway protein-related protein  31.91 
 
 		 271 aa  55.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  30.92 
 
 		 428 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  25.92 
 
 		 459 aa  54.7  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  26.14 
 
 		 357 aa  54.7  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.43 
 
 		 562 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  30.92 
 
 		 428 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1030  general secretion pathway protein A  27.52 
 
 		 320 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00881191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0474  hypothetical protein  26.17 
 
 		 469 aa  53.9  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  26.03 
 
 		 346 aa  53.9  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  21.6 
 
 		 422 aa  53.9  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  30.91 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  30.56 
 
 		 432 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  30.91 
 
 		 425 aa  53.9  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  30.91 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  26.92 
 
 		 529 aa  53.5  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2048  general secretion pathway protein-related protein  32.35 
 
 		 271 aa  53.5  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00486349  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1286  general secretion pathway protein-related protein  32.35 
 
 		 271 aa  53.5  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.385442  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  30.91 
 
 		 425 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  30.91 
 
 		 425 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4519  general secretion pathway protein-related protein  32.35 
 
 		 271 aa  53.5  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  27.38 
 
 		 300 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0640  putative lipoprotein, may be involved in cell division  36.71 
 
 		 185 aa  53.5  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0255277  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  26.56 
 
 		 395 aa  53.5  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12827  hypothetical protein  27.01 
 
 		 270 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.12444e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  34.15 
 
 		 338 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  25.22 
 
 		 281 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.08 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.9 
 
 		 613 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  25.73 
 
 		 538 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  28 
 
 		 281 aa  52.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>