164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_45230 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1068    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  50.81 
 
 
526 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  50.62 
 
 
533 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  54.4 
 
 
548 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  54.4 
 
 
551 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  57.91 
 
 
533 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  53.87 
 
 
540 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  54.52 
 
 
541 aa  326  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  56.1 
 
 
529 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  50.6 
 
 
534 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  30.29 
 
 
521 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  57.45 
 
 
533 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  27.54 
 
 
525 aa  99.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2684  triosephosphate isomerase  27.09 
 
 
494 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.882617  normal  0.208617 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2280  Sporulation domain protein  32.09 
 
 
499 aa  78.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  31.93 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  31.49 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  35.77 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1303  type II secretory pathway ATPase ExeA  28.17 
 
 
303 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  35.77 
 
 
274 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  32.77 
 
 
428 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  35.37 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  32.2 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  31.52 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  32.2 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  32.2 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  32.2 
 
 
428 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  33.12 
 
 
428 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  30.54 
 
 
320 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  30.17 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  30.4 
 
 
340 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  32.5 
 
 
506 aa  67.8  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  30.43 
 
 
371 aa  66.2  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  28.63 
 
 
368 aa  65.1  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  30.83 
 
 
353 aa  65.1  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.87412 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  28.89 
 
 
428 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  28.89 
 
 
428 aa  64.3  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  29.88 
 
 
323 aa  63.9  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  28.81 
 
 
266 aa  63.9  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  27.71 
 
 
540 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  30.47 
 
 
306 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  26.07 
 
 
563 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  27.19 
 
 
357 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  28.93 
 
 
341 aa  62.4  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  35.44 
 
 
329 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  22.85 
 
 
422 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  35.44 
 
 
329 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  28.81 
 
 
266 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  30.43 
 
 
306 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  35.44 
 
 
329 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  28.26 
 
 
432 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  27.56 
 
 
831 aa  62  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  30.59 
 
 
298 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  30.81 
 
 
427 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.22 
 
 
364 aa  60.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  30.56 
 
 
349 aa  60.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  36.44 
 
 
349 aa  60.5  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  29.51 
 
 
301 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  27.23 
 
 
266 aa  60.1  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.71 
 
 
562 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0833  sporulation domain-containing protein  29 
 
 
491 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.210508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.16 
 
 
558 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  30.46 
 
 
261 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  29.34 
 
 
302 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.21 
 
 
562 aa  58.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  27.23 
 
 
261 aa  58.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  29.96 
 
 
304 aa  58.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.57 
 
 
395 aa  58.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  27.2 
 
 
358 aa  57.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  30.04 
 
 
305 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  27.43 
 
 
266 aa  57.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  28.34 
 
 
303 aa  57.4  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0377  sporulation domain-containing protein  35.04 
 
 
467 aa  57.4  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0555  AAA ATPase  31.02 
 
 
271 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0572  AAA ATPase  31.02 
 
 
271 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1689  AAA ATPase  31.02 
 
 
271 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2502  AAA ATPase  31.02 
 
 
271 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2927  AAA ATPase  31.02 
 
 
271 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600702  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  31.82 
 
 
350 aa  57.4  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.87 
 
 
532 aa  57  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  30.16 
 
 
300 aa  57  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5571  AAA ATPase  31.02 
 
 
271 aa  57  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800357  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0447  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  28.11 
 
 
277 aa  57  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  30.54 
 
 
257 aa  56.6  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  30.66 
 
 
336 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1503  peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 
542 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3366  DamX domain-containing protein  26.64 
 
 
512 aa  56.6  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  26.5 
 
 
563 aa  57  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  28.7 
 
 
459 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5447  AAA ATPase  30.88 
 
 
271 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739293  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  27.14 
 
 
616 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  25.1 
 
 
390 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.02 
 
 
562 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  26.45 
 
 
554 aa  55.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  35.25 
 
 
389 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.03 
 
 
562 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0854  AAA ATPase  26.71 
 
 
285 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239928  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.69 
 
 
557 aa  54.3  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.5 
 
 
395 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  25.77 
 
 
392 aa  53.5  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>