66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2684 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2684  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 494 aa  975    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.882617  normal  0.208617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  24.25 
 
 		 521 aa  123  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  24.39 
 
 		 525 aa  87.8  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  25.1 
 
 		 505 aa  75.5  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  36.59 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  36.59 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  36.59 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  36.59 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  36.59 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  36.59 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  36.59 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  36.59 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  36.59 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  35.71 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  35.8 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  34.15 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  34.15 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  34.15 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  34.15 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  34.15 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  26.87 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  34.48 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0996  hypothetical protein  21.41 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  31.33 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  31.33 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  31.33 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  33.87 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  25.96 
 
 		 551 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  27.66 
 
 		 533 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  33.73 
 
 		 340 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0833  sporulation domain-containing protein  40.28 
 
 		 491 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.210508  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0965  hypothetical protein  21.28 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  27.66 
 
 		 526 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  31.07 
 
 		 616 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  23.76 
 
 		 504 aa  53.5  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  26.6 
 
 		 533 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  27.78 
 
 		 534 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  22.9 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  26.6 
 
 		 529 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  29.06 
 
 		 364 aa  51.6  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  28.09 
 
 		 323 aa  51.2  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  27.06 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  28.57 
 
 		 548 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  28.09 
 
 		 323 aa  50.4  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  32.48 
 
 		 341 aa  50.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  32.98 
 
 		 506 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  23.91 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  25.65 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  29.41 
 
 		 540 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  27.34 
 
 		 831 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0215  sporulation domain-containing protein  21.32 
 
 		 511 aa  47.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0241134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  27.06 
 
 		 541 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  28 
 
 		 338 aa  47.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  24.79 
 
 		 740 aa  47  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.82 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2332  ATPase  26.03 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53645  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1354  hypothetical protein  25.27 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0537927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  27.87 
 
 		 320 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1803  phage tail X family protein  25.62 
 
 		 586 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06425  hypothetical protein  29.07 
 
 		 118 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  24.1 
 
 		 459 aa  44.3  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  24.88 
 
 		 563 aa  43.5  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  25.71 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>