59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3881 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  673    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  88.79 
 
 		 336 aa  566  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  55.4 
 
 		 349 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  53.51 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  52.66 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  52.69 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  52.69 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  52.69 
 
 		 329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  38.8 
 
 		 425 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  38.41 
 
 		 428 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  38.77 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  38.77 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  38.77 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  39.25 
 
 		 428 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  38.11 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  38.11 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  38.48 
 
 		 432 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  38.81 
 
 		 426 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  39.24 
 
 		 425 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  39.24 
 
 		 425 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  39.24 
 
 		 425 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  39.24 
 
 		 425 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  39.24 
 
 		 425 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  36.84 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  35.64 
 
 		 525 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  36.84 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  35.87 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  23.94 
 
 		 505 aa  57  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  30.12 
 
 		 504 aa  57  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0640  putative lipoprotein, may be involved in cell division  31.15 
 
 		 185 aa  57  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0255277  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1354  hypothetical protein  25.87 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0537927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2684  triosephosphate isomerase  33.33 
 
 		 494 aa  56.6  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.882617  normal  0.208617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  25 
 
 		 521 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  34.26 
 
 		 533 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0104  sporulation domain-containing protein  35.09 
 
 		 507 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  34.15 
 
 		 541 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  34.15 
 
 		 540 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000155  DamX-related protein  50 
 
 		 189 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.678183  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  25.58 
 
 		 533 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05786  hypothetical protein  35.44 
 
 		 189 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0664  hypothetical protein  30.23 
 
 		 491 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.564671  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  31.17 
 
 		 616 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0474  hypothetical protein  36.76 
 
 		 469 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00508  DamX-related protein  29.89 
 
 		 503 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.512931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  26.51 
 
 		 497 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  27.71 
 
 		 491 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  32.1 
 
 		 534 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  29.27 
 
 		 550 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  32.1 
 
 		 533 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0165  sporulation domain-containing protein  32.14 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  32.1 
 
 		 529 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  31.25 
 
 		 526 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0516  putative lipoprotein  31.33 
 
 		 195 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0833  sporulation domain-containing protein  32.89 
 
 		 491 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.210508  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0965  hypothetical protein  28.38 
 
 		 483 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0996  hypothetical protein  29.11 
 
 		 483 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2280  Sporulation domain protein  22.76 
 
 		 499 aa  43.5  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06425  hypothetical protein  28.42 
 
 		 118 aa  42.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  25.84 
 
 		 551 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>