29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0165 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0165  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
311 aa  627  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  29.47 
 
 
491 aa  53.9  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  28.26 
 
 
504 aa  52.8  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  35.71 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  29.35 
 
 
497 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  33.33 
 
 
505 aa  49.3  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  31.07 
 
 
323 aa  49.3  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  31.07 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  31.33 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  31.33 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  31.33 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  32.61 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  32.14 
 
 
338 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  35.62 
 
 
432 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  35.62 
 
 
425 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  35.62 
 
 
428 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  35.62 
 
 
428 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  35.62 
 
 
428 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  30.95 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  35.62 
 
 
428 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  35.62 
 
 
428 aa  44.3  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  34.25 
 
 
425 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  34.25 
 
 
425 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  34.25 
 
 
425 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  34.25 
 
 
425 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  34.25 
 
 
425 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  35.62 
 
 
428 aa  44.3  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  35.62 
 
 
428 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>