56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0340 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  699    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  64.29 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  55.4 
 
 		 338 aa  318  7e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  55.65 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  51.53 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  46.78 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  46.78 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  46.78 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  38.01 
 
 		 426 aa  176  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  37.22 
 
 		 425 aa  172  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  36.97 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  36.97 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  36.97 
 
 		 428 aa  169  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  36.75 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  36.75 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  36.2 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  36.2 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  35.76 
 
 		 432 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  36.71 
 
 		 425 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  36.71 
 
 		 425 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  36.39 
 
 		 425 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  36.39 
 
 		 425 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  36.39 
 
 		 425 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  35.64 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  25.97 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2684  triosephosphate isomerase  35.71 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.882617  normal  0.208617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  35.58 
 
 		 526 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  37.36 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  38.75 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  35.42 
 
 		 533 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  38.75 
 
 		 529 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  31.08 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  31.33 
 
 		 521 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  31.4 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  31.08 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  32.14 
 
 		 504 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  35.44 
 
 		 550 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0640  putative lipoprotein, may be involved in cell division  33.33 
 
 		 185 aa  53.1  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0255277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0664  hypothetical protein  30.43 
 
 		 491 aa  53.1  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.564671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2280  Sporulation domain protein  25.29 
 
 		 499 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  30 
 
 		 551 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  30 
 
 		 548 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  35 
 
 		 540 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  35 
 
 		 541 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0165  sporulation domain-containing protein  35.71 
 
 		 311 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0833  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 		 491 aa  49.7  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.210508  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  24.76 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1354  hypothetical protein  27.89 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0537927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  32.1 
 
 		 525 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0516  putative lipoprotein  27.94 
 
 		 195 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0104  sporulation domain-containing protein  28.92 
 
 		 507 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  28.92 
 
 		 497 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05786  hypothetical protein  31.65 
 
 		 189 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  29.11 
 
 		 616 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000155  DamX-related protein  28.32 
 
 		 189 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.678183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00508  DamX-related protein  29.81 
 
 		 503 aa  42.7  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.512931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>