201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0412 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  70.93 
 
 		 541 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  71.56 
 
 		 540 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1061    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  72.04 
 
 		 526 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  69.09 
 
 		 529 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  69.89 
 
 		 533 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  73.88 
 
 		 534 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  64.27 
 
 		 548 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  63.5 
 
 		 551 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  62.01 
 
 		 533 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  52.57 
 
 		 550 aa  326  6e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  28.14 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  27.64 
 
 		 525 aa  105  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2280  Sporulation domain protein  29.57 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  31.84 
 
 		 323 aa  76.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2684  triosephosphate isomerase  22.51 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.882617  normal  0.208617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  27.64 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  29.88 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  37.61 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0996  hypothetical protein  20.83 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  36.59 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  29.23 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  27.65 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  33.2 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  28.87 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  29.34 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  32.79 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  33.2 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  40.86 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  29.52 
 
 		 266 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  26.28 
 
 		 549 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0965  hypothetical protein  24.49 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  28.06 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  33.8 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  28.4 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  27.13 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  38.27 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  38.27 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  38.27 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0215  ATPase  26.32 
 
 		 570 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  32.69 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  32.69 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  32.69 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  32.69 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  32.69 
 
 		 425 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  25.25 
 
 		 540 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  28.23 
 
 		 267 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  27.1 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  28.51 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  30.1 
 
 		 281 aa  62  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0833  sporulation domain-containing protein  26.83 
 
 		 491 aa  62  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.210508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  27.59 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  27.24 
 
 		 459 aa  60.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  26.91 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  26.36 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  27.36 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  28.11 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  28.11 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  28.11 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0104  sporulation domain-containing protein  24.52 
 
 		 507 aa  60.5  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  32.48 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3704  sporulation domain-containing protein  28.79 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16262  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  32.48 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  32.48 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  23.4 
 
 		 491 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  31.9 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  31.9 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  31.9 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  31.9 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  31.9 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  26.51 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  28.4 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1925  putative ATPase  28.26 
 
 		 749 aa  58.5  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.118483  hitchhiker  0.0000000000629978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  26.86 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1303  type II secretory pathway ATPase ExeA  25.1 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  27.49 
 
 		 831 aa  57.4  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  22.79 
 
 		 740 aa  57.4  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  29.44 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  28.4 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1503  peptidoglycan-binding LysM  24.51 
 
 		 542 aa  57  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  27.54 
 
 		 308 aa  57  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  29.15 
 
 		 309 aa  57  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  24.82 
 
 		 505 aa  57  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  28.29 
 
 		 267 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4945  general secretion pathway protein-related protein  32.06 
 
 		 271 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  23.67 
 
 		 388 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  28.28 
 
 		 300 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  27.27 
 
 		 306 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  27.27 
 
 		 306 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0884  AAA ATPase  30.29 
 
 		 318 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3743  general secretion pathway protein-related protein  30.99 
 
 		 301 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.122195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  29.15 
 
 		 309 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  33.61 
 
 		 336 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  28.11 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  28.4 
 
 		 414 aa  55.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.67 
 
 		 562 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  29.02 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  30.23 
 
 		 616 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1803  phage tail X family protein  22.96 
 
 		 586 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.411442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>