139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0266 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  100 
 
 
616 aa  1212    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  35.8 
 
 
506 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  41.63 
 
 
525 aa  117  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  38.03 
 
 
489 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  42.17 
 
 
444 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  28.86 
 
 
281 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  58.82 
 
 
268 aa  65.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  43.01 
 
 
926 aa  65.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  23.86 
 
 
577 aa  63.5  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  37.07 
 
 
630 aa  63.2  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  36.64 
 
 
484 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.86 
 
 
580 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  24.61 
 
 
563 aa  62.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.87 
 
 
541 aa  62  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.09 
 
 
372 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.79 
 
 
568 aa  61.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  27.4 
 
 
308 aa  61.2  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  32.22 
 
 
533 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.66 
 
 
589 aa  60.5  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  32.56 
 
 
529 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  29.51 
 
 
427 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.09 
 
 
372 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  32.95 
 
 
521 aa  60.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  27.34 
 
 
3521 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  25.96 
 
 
563 aa  58.9  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.6 
 
 
562 aa  58.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12827  hypothetical protein  30.39 
 
 
270 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.12444e-28  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2684  triosephosphate isomerase  29.63 
 
 
494 aa  58.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.882617  normal  0.208617 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  31.91 
 
 
3471 aa  57.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  31.91 
 
 
3472 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  28.65 
 
 
428 aa  57  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0104  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
507 aa  57  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  29.79 
 
 
425 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  30 
 
 
526 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  30.77 
 
 
428 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  27.24 
 
 
459 aa  55.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  30.77 
 
 
432 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  30.77 
 
 
428 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  30.23 
 
 
533 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  23.33 
 
 
498 aa  55.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  30.77 
 
 
425 aa  55.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  29.67 
 
 
323 aa  55.1  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.26 
 
 
538 aa  55.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  30.77 
 
 
425 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  30.77 
 
 
425 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  30.77 
 
 
425 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.64 
 
 
558 aa  54.7  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  30.77 
 
 
425 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.51 
 
 
557 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  26.22 
 
 
275 aa  54.3  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.51 
 
 
557 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  32.18 
 
 
548 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.51 
 
 
557 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  34.4 
 
 
423 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.51 
 
 
557 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  32.23 
 
 
2272 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  25 
 
 
572 aa  53.5  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.23 
 
 
562 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.61 
 
 
557 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.23 
 
 
562 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  25.96 
 
 
392 aa  53.5  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.09 
 
 
587 aa  53.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  28.57 
 
 
928 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  25.37 
 
 
437 aa  52.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  34.75 
 
 
3409 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.23 
 
 
562 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  31.03 
 
 
551 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  30.23 
 
 
491 aa  52.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  28.57 
 
 
323 aa  52.8  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  32.47 
 
 
534 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.14 
 
 
562 aa  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  23.89 
 
 
390 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  28.77 
 
 
2179 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.93 
 
 
559 aa  51.6  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  24.18 
 
 
532 aa  51.6  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  35.29 
 
 
1261 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  31.17 
 
 
336 aa  51.2  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  34.96 
 
 
522 aa  50.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.51 
 
 
613 aa  50.8  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1354  hypothetical protein  30.43 
 
 
382 aa  50.4  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0537927  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  26.23 
 
 
554 aa  50.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  28.57 
 
 
329 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  28.57 
 
 
329 aa  50.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  28.57 
 
 
329 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  24.4 
 
 
368 aa  49.3  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  24.9 
 
 
349 aa  49.7  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  22.46 
 
 
422 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  27.49 
 
 
300 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  19.64 
 
 
584 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  26.51 
 
 
831 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  35.14 
 
 
1888 aa  49.3  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  22.9 
 
 
385 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  25.29 
 
 
341 aa  48.9  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  25.79 
 
 
291 aa  48.9  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1030  general secretion pathway protein A  24.34 
 
 
320 aa  48.5  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00881191 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  26.42 
 
 
302 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>