176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4950 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  87.41 
 
 		 526 aa  810    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  97.75 
 
 		 529 aa  837    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  71.14 
 
 		 533 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  93.12 
 
 		 534 aa  806    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 533 aa  1058    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  68.34 
 
 		 541 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  67.81 
 
 		 540 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  62.53 
 
 		 551 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  63.95 
 
 		 548 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  59.06 
 
 		 533 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  52.1 
 
 		 550 aa  330  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  28.91 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  25.53 
 
 		 525 aa  99.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2684  triosephosphate isomerase  24.76 
 
 		 494 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.882617  normal  0.208617 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2280  Sporulation domain protein  29.51 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  27.09 
 
 		 532 aa  71.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  30.68 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  28.79 
 
 		 261 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  29.01 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  29.01 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  30.24 
 
 		 506 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  23.79 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  25.28 
 
 		 549 aa  68.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  28.69 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1303  type II secretory pathway ATPase ExeA  24.8 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  29.67 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  30.08 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  29.64 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  32.73 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  31.66 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  29.88 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  25 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  30.08 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  32.73 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  32.73 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  32.73 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  28.28 
 
 		 261 aa  67  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  25.57 
 
 		 371 aa  67  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  34.88 
 
 		 349 aa  66.6  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  29.83 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0996  hypothetical protein  26.99 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  29.01 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.55 
 
 		 587 aa  65.1  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0104  sporulation domain-containing protein  24.66 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  32.7 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  22.48 
 
 		 740 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  25.38 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  36.24 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  25.71 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0965  hypothetical protein  26.38 
 
 		 483 aa  63.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  39.51 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  39.51 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  39.51 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  25.1 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  27.67 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  28.57 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  31.25 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  26.71 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  24.7 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  32.22 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  26.71 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  28.19 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  28.09 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  23.33 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  36.07 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  25.29 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  30.67 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  30.67 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  27.61 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  25.9 
 
 		 353 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.35 
 
 		 558 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  29.59 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  24.9 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  24.52 
 
 		 358 aa  57  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0215  ATPase  27.14 
 
 		 570 aa  57  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  25.38 
 
 		 341 aa  57  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.77 
 
 		 562 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.77 
 
 		 562 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  25.41 
 
 		 831 aa  56.6  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.77 
 
 		 562 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  27.71 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0854  AAA ATPase  25.78 
 
 		 285 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239928  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  24.38 
 
 		 541 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  27.72 
 
 		 308 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  23.77 
 
 		 554 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  25.11 
 
 		 385 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.29 
 
 		 562 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  35.77 
 
 		 389 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  22.58 
 
 		 388 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  26.75 
 
 		 529 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0447  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  24.56 
 
 		 277 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  21.69 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1925  putative ATPase  27.24 
 
 		 749 aa  55.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.118483  hitchhiker  0.0000000000629978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  33.33 
 
 		 336 aa  54.7  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0833  sporulation domain-containing protein  26.4 
 
 		 491 aa  54.3  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.210508  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  30.53 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  30.53 
 
 		 425 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  30.53 
 
 		 425 aa  54.3  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  30.53 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  24.17 
 
 		 390 aa  54.3  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>