161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0447 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0447  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  100 
 
 		 277 aa  554  1e-157  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  28.97 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  28.68 
 
 		 831 aa  85.5  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  29.39 
 
 		 549 aa  79.3  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  27.92 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  30.15 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  28.96 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  29.18 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.63 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.97 
 
 		 564 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.35 
 
 		 562 aa  77  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.34 
 
 		 532 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  27 
 
 		 414 aa  75.9  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  28.9 
 
 		 393 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  27.59 
 
 		 392 aa  75.5  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  27.41 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  26.47 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  26.25 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  23.35 
 
 		 505 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  31.32 
 
 		 540 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  28.47 
 
 		 563 aa  72.4  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  24.71 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0854  AAA ATPase  28.42 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239928  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.03 
 
 		 568 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.08 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  27.69 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  25.58 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.21 
 
 		 589 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.64 
 
 		 580 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  26.72 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  27.13 
 
 		 584 aa  69.3  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  23.16 
 
 		 563 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  26.64 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  26.02 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.57 
 
 		 577 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  26.98 
 
 		 341 aa  67  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  27.68 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.64 
 
 		 562 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  26.02 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.84 
 
 		 587 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.79 
 
 		 536 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  29.37 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  23.28 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  26.94 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  26.75 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  25.37 
 
 		 498 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  29.37 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  26.34 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  26.57 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.59 
 
 		 562 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.82 
 
 		 613 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  26.82 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  28.57 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2332  ATPase  26.52 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  23.79 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  27.42 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.12 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.12 
 
 		 557 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 558 aa  63.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.12 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.12 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  26.91 
 
 		 439 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  25.66 
 
 		 427 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.75 
 
 		 559 aa  62  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.8 
 
 		 536 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  26.72 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  25 
 
 		 554 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  20.88 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.8 
 
 		 536 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5447  AAA ATPase  23.95 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1621  ATPase  26.64 
 
 		 644 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  23.6 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  27.8 
 
 		 570 aa  59.7  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1342  MSHA biogenesis protein MshM  24.51 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 556 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  25 
 
 		 562 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  27.13 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5571  AAA ATPase  23.19 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  25 
 
 		 562 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.28 
 
 		 562 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1030  general secretion pathway protein A  27.31 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00881191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  26.55 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  27.44 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  24.89 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  28.92 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  28.92 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  25.48 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  21.09 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  24.91 
 
 		 740 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0555  AAA ATPase  22.81 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0572  AAA ATPase  22.81 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1689  AAA ATPase  22.81 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2502  AAA ATPase  22.81 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2927  AAA ATPase  22.81 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600702  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1995  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.57 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  26.36 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  28.92 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.53 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.57 
 
 		 557 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  24.81 
 
 		 266 aa  57  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>