196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0854 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0854  AAA ATPase  100 
 
 		 285 aa  581  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  38.25 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  38.25 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  36.43 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  36.52 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  36.04 
 
 		 266 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  33.81 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  32.3 
 
 		 389 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  31.62 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  29.68 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  32.75 
 
 		 346 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  30.74 
 
 		 390 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  31.01 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  31.01 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  29.43 
 
 		 393 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  29.66 
 
 		 282 aa  109  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  31.01 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  31.34 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  31.34 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  31.34 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  29.5 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  31.34 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1303  type II secretory pathway ATPase ExeA  26.88 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.93 
 
 		 558 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.42 
 
 		 577 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  28.62 
 
 		 368 aa  106  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.42 
 
 		 580 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.18 
 
 		 562 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  31.2 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  31.03 
 
 		 584 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  31.32 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  29.82 
 
 		 563 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  29.62 
 
 		 563 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  31.56 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.86 
 
 		 562 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  27.97 
 
 		 334 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  31.93 
 
 		 519 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  31.82 
 
 		 549 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  32.58 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  31.36 
 
 		 303 aa  99.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  30.11 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  32.58 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  27.78 
 
 		 341 aa  99  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  31.83 
 
 		 392 aa  99  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  29.23 
 
 		 371 aa  99  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  30.25 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  32.33 
 
 		 831 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  31.01 
 
 		 563 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  29.33 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.99 
 
 		 353 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.66 
 
 		 541 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.04 
 
 		 587 aa  97.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  31.41 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1683  AAA ATPase  31.45 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  30.42 
 
 		 385 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.04 
 
 		 572 aa  96.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  29.33 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  32.4 
 
 		 554 aa  96.3  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2821  AAA ATPase  31.45 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  30.39 
 
 		 304 aa  96.3  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  29.68 
 
 		 302 aa  96.3  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3192  AAA ATPase  31.45 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0103518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.95 
 
 		 536 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1711  AAA ATPase  31.45 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 613 aa  96.3  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2001  AAA ATPase  31.45 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.249052  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  27.51 
 
 		 505 aa  96.3  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.45 
 
 		 538 aa  95.5  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  29.82 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  31.84 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.71 
 
 		 564 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  29.6 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 562 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1829  AAA ATPase  26.13 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.569708 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  28.98 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  29.66 
 
 		 364 aa  93.6  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  27.53 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  29.08 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.74 
 
 		 568 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.45 
 
 		 557 aa  93.2  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1106  AAA ATPase  26.24 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.597508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1875  AAA ATPase  26.24 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.871076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0382  AAA ATPase  26.24 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1329  AAA ATPase  26.24 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0545  AAA ATPase  26.24 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  26.13 
 
 		 368 aa  92.4  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0311  AAA ATPase  29.68 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  30.99 
 
 		 338 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.52 
 
 		 589 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  30.6 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.36 
 
 		 536 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 562 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 562 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 562 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  28.47 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1681  AAA ATPase  29.47 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28 
 
 		 536 aa  90.5  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  25.94 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  29.04 
 
 		 372 aa  90.1  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  27.78 
 
 		 541 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>