157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0104 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0104  sporulation domain-containing protein  100 
 
 
507 aa  1002    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  35.38 
 
 
525 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  23.21 
 
 
521 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  24.61 
 
 
459 aa  67.4  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  36.59 
 
 
329 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  27.87 
 
 
334 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  36.59 
 
 
329 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  36.59 
 
 
329 aa  66.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  26.97 
 
 
341 aa  65.1  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  37.78 
 
 
336 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  36.36 
 
 
616 aa  63.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  34.12 
 
 
340 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  36.96 
 
 
338 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  26.21 
 
 
267 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  25.94 
 
 
357 aa  62  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  25.6 
 
 
541 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  28.29 
 
 
308 aa  61.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  29.1 
 
 
323 aa  61.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.43 
 
 
587 aa  60.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.51 
 
 
559 aa  60.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  28.86 
 
 
549 aa  60.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  25.71 
 
 
532 aa  60.5  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  26.84 
 
 
266 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  27.93 
 
 
300 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  24.15 
 
 
557 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.15 
 
 
557 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.15 
 
 
557 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  27.42 
 
 
267 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  25.41 
 
 
368 aa  58.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.43 
 
 
562 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  30.53 
 
 
350 aa  58.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  26.27 
 
 
346 aa  57.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  25.88 
 
 
831 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.43 
 
 
562 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  25.97 
 
 
266 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  25.41 
 
 
302 aa  57.4  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  25.4 
 
 
584 aa  57  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  27.46 
 
 
368 aa  57  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  26 
 
 
414 aa  57  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  22.75 
 
 
554 aa  56.2  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  38.71 
 
 
506 aa  56.6  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.43 
 
 
562 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  27.73 
 
 
266 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  23.71 
 
 
284 aa  56.6  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  25.12 
 
 
538 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.84 
 
 
557 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  26.77 
 
 
281 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  28.05 
 
 
428 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  28.05 
 
 
428 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  28.05 
 
 
428 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  28.05 
 
 
428 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  28.05 
 
 
428 aa  54.3  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  28.05 
 
 
428 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  28.05 
 
 
428 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  28.05 
 
 
432 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  27.35 
 
 
291 aa  53.9  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  23.51 
 
 
302 aa  54.3  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  28.05 
 
 
425 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  31.33 
 
 
349 aa  53.9  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  26.88 
 
 
291 aa  53.5  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  27.41 
 
 
323 aa  53.5  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  27.4 
 
 
563 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  28.74 
 
 
310 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  29.67 
 
 
302 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  27.41 
 
 
323 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  28.05 
 
 
425 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  28.4 
 
 
341 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3331  general secretion pathway protein, ATPase  28.46 
 
 
310 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0818579  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  28.05 
 
 
425 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  28.05 
 
 
425 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  28.74 
 
 
309 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  28.74 
 
 
309 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  28.05 
 
 
425 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  23.84 
 
 
519 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  29.48 
 
 
308 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  28.05 
 
 
425 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.41 
 
 
558 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  27.94 
 
 
310 aa  51.6  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  26.85 
 
 
358 aa  52  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  28.4 
 
 
533 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1503  peptidoglycan-binding LysM  23.66 
 
 
542 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  25.82 
 
 
563 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  29.67 
 
 
302 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  25.88 
 
 
426 aa  52  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  29.67 
 
 
302 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  29.67 
 
 
302 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  26.27 
 
 
266 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  25.63 
 
 
338 aa  51.2  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.56 
 
 
538 aa  50.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  25 
 
 
613 aa  51.2  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0640  putative lipoprotein, may be involved in cell division  30.48 
 
 
185 aa  50.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0255277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  27.66 
 
 
257 aa  50.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  23.43 
 
 
388 aa  50.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0996  hypothetical protein  19.47 
 
 
483 aa  50.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.24 
 
 
557 aa  50.1  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  25.81 
 
 
274 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  29.05 
 
 
275 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  23.08 
 
 
354 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.52 
 
 
541 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.69 
 
 
562 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>