195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3032 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  100 
 
 
506 aa  1004    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  32.65 
 
 
525 aa  176  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  35.8 
 
 
616 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  28.05 
 
 
521 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0104  sporulation domain-containing protein  30.6 
 
 
507 aa  94.4  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.33 
 
 
532 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.77 
 
 
557 aa  82  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.46 
 
 
564 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.24 
 
 
562 aa  80.1  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  26.97 
 
 
308 aa  79.7  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.05 
 
 
562 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.63 
 
 
613 aa  79  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  39.18 
 
 
529 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2684  triosephosphate isomerase  24.16 
 
 
494 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.882617  normal  0.208617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  41.76 
 
 
340 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.16 
 
 
541 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.21 
 
 
587 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  27.39 
 
 
554 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  37 
 
 
526 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.75 
 
 
538 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.39 
 
 
562 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.39 
 
 
562 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.39 
 
 
562 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  26.8 
 
 
563 aa  74.3  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.78 
 
 
536 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  37.36 
 
 
349 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  27.1 
 
 
310 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  28.68 
 
 
459 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  27.5 
 
 
302 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  27.82 
 
 
563 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  35.34 
 
 
350 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  27.5 
 
 
302 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  27.5 
 
 
302 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  27.5 
 
 
302 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  28.4 
 
 
281 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.5 
 
 
558 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  31.95 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  27.46 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  27.05 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  31.95 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  27.5 
 
 
540 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  32.7 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  31.95 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  31.95 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  25.41 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  32.7 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.69 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.57 
 
 
572 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  26.64 
 
 
519 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  33.51 
 
 
549 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  38.55 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1503  peptidoglycan-binding LysM  25.31 
 
 
542 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  38.55 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  38.55 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  35.87 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  25.28 
 
 
291 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.16 
 
 
559 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  24.91 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  26.45 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  26.36 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  34.78 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  26.25 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0215  ATPase  28.74 
 
 
570 aa  68.2  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  37.21 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  25.6 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  33.64 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  26.23 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  26.45 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  27.37 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  28.57 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  33.64 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  33.64 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  34.01 
 
 
533 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  27.46 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  30.52 
 
 
274 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  26.23 
 
 
309 aa  67  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  39.77 
 
 
550 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  31.44 
 
 
261 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.39 
 
 
536 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.39 
 
 
536 aa  66.6  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  36.05 
 
 
425 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  36.05 
 
 
425 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  26 
 
 
395 aa  65.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  23.74 
 
 
320 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  36.05 
 
 
425 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  36.05 
 
 
425 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  36.05 
 
 
425 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1925  putative ATPase  28.4 
 
 
749 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.118483  hitchhiker  0.0000000000629978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  25.83 
 
 
296 aa  64.7  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  25.82 
 
 
302 aa  64.3  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.73 
 
 
557 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.73 
 
 
557 aa  64.3  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  26.19 
 
 
831 aa  64.3  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  28.1 
 
 
267 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.73 
 
 
557 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.73 
 
 
557 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  25.2 
 
 
354 aa  63.9  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  32.59 
 
 
279 aa  63.9  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  23.72 
 
 
532 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  25.31 
 
 
505 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>