168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0389 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 526 aa  1050    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  87.31 
 
 		 529 aa  758    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  68.88 
 
 		 541 aa  636    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  70.46 
 
 		 540 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  70.64 
 
 		 533 aa  685    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  85.45 
 
 		 534 aa  745    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  86.48 
 
 		 533 aa  746    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  64.55 
 
 		 551 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  64.92 
 
 		 548 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  61.97 
 
 		 533 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  50.96 
 
 		 550 aa  312  9e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  29.76 
 
 		 521 aa  191  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  25.54 
 
 		 525 aa  82.4  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2280  Sporulation domain protein  28.91 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2684  triosephosphate isomerase  22.93 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.882617  normal  0.208617 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0965  hypothetical protein  20.73 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  30.98 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  31.37 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  29.37 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  31.37 
 
 		 274 aa  72  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  31.17 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  26 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  32.11 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  29.64 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  28.57 
 
 		 338 aa  67  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  28.36 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  28.36 
 
 		 306 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  33.73 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0996  hypothetical protein  26.99 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  33.73 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  33.73 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  26.1 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  33.73 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  26.94 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  29.62 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  33.73 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  33.73 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  37 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  30.16 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  33.9 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  28.36 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  25 
 
 		 357 aa  63.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  32.23 
 
 		 320 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  24.03 
 
 		 540 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  38.75 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  38.75 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  38.75 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  31.93 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  25.99 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.24 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  31.93 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  24.15 
 
 		 549 aa  60.5  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  34.46 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  24.19 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  27.43 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1925  putative ATPase  26.54 
 
 		 749 aa  60.5  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.118483  hitchhiker  0.0000000000629978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  25.38 
 
 		 358 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  25.95 
 
 		 437 aa  60.1  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1303  type II secretory pathway ATPase ExeA  25 
 
 		 303 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  28.79 
 
 		 261 aa  60.1  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0884  AAA ATPase  30 
 
 		 318 aa  60.1  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  31.18 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  30.63 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0833  sporulation domain-containing protein  27.24 
 
 		 491 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.210508  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.61 
 
 		 562 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0104  sporulation domain-containing protein  25.61 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.09 
 
 		 353 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  30 
 
 		 616 aa  57  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  26.92 
 
 		 341 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  25.6 
 
 		 498 aa  56.6  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1803  phage tail X family protein  21.75 
 
 		 586 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  30.88 
 
 		 426 aa  56.6  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  27.78 
 
 		 261 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  24.46 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  27.82 
 
 		 304 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  26.64 
 
 		 308 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  23.79 
 
 		 388 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  26.61 
 
 		 831 aa  55.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  27.86 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.17 
 
 		 562 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  30.72 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0854  AAA ATPase  25.39 
 
 		 285 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239928  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  23.29 
 
 		 584 aa  54.7  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  30.72 
 
 		 425 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  30.72 
 
 		 425 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  30.72 
 
 		 425 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  30.72 
 
 		 425 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  30.61 
 
 		 323 aa  54.3  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  27.87 
 
 		 267 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1030  general secretion pathway protein A  27.78 
 
 		 320 aa  53.9  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00881191 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  26.05 
 
 		 323 aa  54.3  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.02 
 
 		 587 aa  53.9  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0447  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  24.12 
 
 		 277 aa  53.9  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.46 
 
 		 562 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  28.24 
 
 		 505 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  22.26 
 
 		 505 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  21.37 
 
 		 557 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  24.05 
 
 		 563 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  24.26 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  28.81 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>