69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2724 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  100 
 
 
505 aa  1021    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  41.92 
 
 
504 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  40.47 
 
 
497 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  39.38 
 
 
491 aa  351  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2684  triosephosphate isomerase  25.4 
 
 
494 aa  75.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.882617  normal  0.208617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0342  sporulation domain-containing protein  29.44 
 
 
464 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4082  sporulation domain-containing protein  24.65 
 
 
483 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3696  sporulation domain-containing protein  26.67 
 
 
471 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  normal  0.829888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0249  sporulation domain-containing protein  26.89 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.899829  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3366  DamX domain-containing protein  25.48 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0288  DamX domain-containing protein  25.51 
 
 
470 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4001  Sporulation domain protein  26.29 
 
 
482 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.512353  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4200  sporulation domain-containing protein  26.29 
 
 
483 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0495455  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4111  sporulation domain-containing protein  26.29 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3892  sporulation domain-containing protein  26.25 
 
 
471 aa  67  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.598853  normal  0.606435 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  32.23 
 
 
323 aa  66.6  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  32.23 
 
 
323 aa  66.6  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0377  sporulation domain-containing protein  24.03 
 
 
467 aa  65.1  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  25.97 
 
 
349 aa  65.1  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  22.05 
 
 
521 aa  64.3  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0263  sporulation related  23.3 
 
 
511 aa  63.5  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0840788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3704  sporulation domain-containing protein  27.53 
 
 
463 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16262  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4263  sporulation domain-containing protein  26.97 
 
 
483 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353854  normal  0.0664789 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  24.87 
 
 
336 aa  61.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  34.83 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  34.83 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  34.83 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  34.83 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  36.05 
 
 
425 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  34.83 
 
 
432 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  34.83 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  34.83 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  34.83 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  34.83 
 
 
426 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  32.1 
 
 
550 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  34.83 
 
 
425 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  34.83 
 
 
425 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  34.83 
 
 
425 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  34.83 
 
 
425 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  34.83 
 
 
425 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  30.86 
 
 
329 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  30.86 
 
 
329 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  30.86 
 
 
329 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0215  sporulation domain-containing protein  27.17 
 
 
511 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0241134 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2280  Sporulation domain protein  20.6 
 
 
499 aa  56.2  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  28.24 
 
 
533 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  26.09 
 
 
350 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  30.49 
 
 
533 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0664  hypothetical protein  22.65 
 
 
491 aa  54.3  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.564671  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  22.7 
 
 
525 aa  53.5  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  26.97 
 
 
340 aa  53.5  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  28.24 
 
 
526 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  23.94 
 
 
338 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5127  sporulation domain-containing protein  28.24 
 
 
534 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.840723  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  27.06 
 
 
540 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0474  hypothetical protein  22.69 
 
 
469 aa  52  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  24.72 
 
 
541 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5077  sporulation domain protein  27.06 
 
 
529 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.560536  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4950  sporulation domain-containing protein  27.06 
 
 
533 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0996  hypothetical protein  30.49 
 
 
483 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  30.59 
 
 
548 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0965  hypothetical protein  28.92 
 
 
483 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  30.59 
 
 
551 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0165  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 
311 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0640  putative lipoprotein, may be involved in cell division  29.73 
 
 
185 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0255277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0240  sporulation domain-containing protein  25 
 
 
493 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000377836  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000155  DamX-related protein  33.33 
 
 
189 aa  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.678183  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05786  hypothetical protein  32.47 
 
 
189 aa  47  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  29.07 
 
 
616 aa  43.9  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>