40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000155 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000155  DamX-related protein  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.678183  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05786  hypothetical protein  91.01 
 
 		 189 aa  353  5.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0516  putative lipoprotein  60.82 
 
 		 195 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0640  putative lipoprotein, may be involved in cell division  42.05 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0255277  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06425  hypothetical protein  35.53 
 
 		 118 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  28.68 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  28.47 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000594  putative DamX-related protein  36.99 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000379555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  31.65 
 
 		 329 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  31.65 
 
 		 329 aa  51.2  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  31.65 
 
 		 329 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  33.77 
 
 		 497 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  50 
 
 		 336 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  50 
 
 		 338 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  31.33 
 
 		 340 aa  47.8  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  33.33 
 
 		 505 aa  47.8  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  32.89 
 
 		 504 aa  45.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  29.2 
 
 		 350 aa  45.1  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  31.33 
 
 		 426 aa  44.7  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  30.38 
 
 		 428 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  30.38 
 
 		 428 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  28.32 
 
 		 349 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  30.38 
 
 		 428 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  29.11 
 
 		 425 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  29.11 
 
 		 425 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  29.11 
 
 		 425 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  29.11 
 
 		 425 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  29.11 
 
 		 425 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  30.38 
 
 		 428 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  30.38 
 
 		 428 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  30.38 
 
 		 428 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  30.38 
 
 		 428 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.05 
 
 		 616 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  30.38 
 
 		 425 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  30.38 
 
 		 432 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  30.86 
 
 		 521 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0996  hypothetical protein  24.55 
 
 		 483 aa  42  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  31.65 
 
 		 491 aa  41.2  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2047  type I secretion outer membrane protein  26.83 
 
 		 616 aa  41.2  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3412  sporulation domain-containing protein  29.36 
 
 		 349 aa  41.2  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>