66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002329 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  100 
 
 		 504 aa  1026    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  76.44 
 
 		 497 aa  747    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  56.13 
 
 		 491 aa  521  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  41.92 
 
 		 505 aa  355  7.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0215  sporulation domain-containing protein  21.43 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0241134 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0263  sporulation related  26.36 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0840788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4263  sporulation domain-containing protein  28.12 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353854  normal  0.0664789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0377  sporulation domain-containing protein  20.78 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3696  sporulation domain-containing protein  29.67 
 
 		 471 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  normal  0.829888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3892  sporulation domain-containing protein  29.27 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.598853  normal  0.606435 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0288  DamX domain-containing protein  23.53 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4001  Sporulation domain protein  24.81 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.512353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0240  sporulation domain-containing protein  23.09 
 
 		 493 aa  72  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000377836  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4200  sporulation domain-containing protein  24.81 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0342  sporulation domain-containing protein  25.99 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4111  sporulation domain-containing protein  25.19 
 
 		 482 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4082  sporulation domain-containing protein  24.82 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3704  sporulation domain-containing protein  29.74 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16262  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3366  DamX domain-containing protein  27.21 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  31.03 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  31.03 
 
 		 428 aa  66.6  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  31.03 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  31.03 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0249  sporulation domain-containing protein  29.03 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.899829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  31.03 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  32.18 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  37.21 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  37.21 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  37.21 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  23.92 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  23.92 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  23.92 
 
 		 329 aa  63.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0664  hypothetical protein  28.57 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.564671  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  36.05 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  36.05 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  36.05 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  36.05 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  36.05 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  31.33 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  31.33 
 
 		 323 aa  59.7  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0474  hypothetical protein  22.22 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  30.12 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  33.71 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  30.12 
 
 		 338 aa  57  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  32.14 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  28.92 
 
 		 340 aa  55.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  30.12 
 
 		 350 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  25.35 
 
 		 525 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0165  sporulation domain-containing protein  28.26 
 
 		 311 aa  52  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0996  hypothetical protein  19.86 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  27.93 
 
 		 616 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06425  hypothetical protein  27.78 
 
 		 118 aa  50.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2684  triosephosphate isomerase  21.64 
 
 		 494 aa  50.4  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.882617  normal  0.208617 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  25.84 
 
 		 521 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0516  putative lipoprotein  33.73 
 
 		 195 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0965  hypothetical protein  23.15 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000594  putative DamX-related protein  30.59 
 
 		 103 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000379555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  26.51 
 
 		 533 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0640  putative lipoprotein, may be involved in cell division  28.21 
 
 		 185 aa  47.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0255277  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  26.19 
 
 		 548 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  24.71 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  26.19 
 
 		 551 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  25.88 
 
 		 533 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  24.72 
 
 		 541 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  23.6 
 
 		 540 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000155  DamX-related protein  32.47 
 
 		 189 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.678183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>