22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0263 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0263  sporulation related  100 
 
 		 511 aa  1039    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0840788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0377  sporulation domain-containing protein  42.97 
 
 		 467 aa  339  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4200  sporulation domain-containing protein  39.65 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4111  sporulation domain-containing protein  39.88 
 
 		 482 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4082  sporulation domain-containing protein  39.62 
 
 		 483 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4001  Sporulation domain protein  39.18 
 
 		 482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.512353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3704  sporulation domain-containing protein  38.79 
 
 		 463 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16262  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0288  DamX domain-containing protein  37.67 
 
 		 470 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3892  sporulation domain-containing protein  36.97 
 
 		 471 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.598853  normal  0.606435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3696  sporulation domain-containing protein  36.61 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  normal  0.829888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0249  sporulation domain-containing protein  37.04 
 
 		 464 aa  286  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.899829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0215  sporulation domain-containing protein  36.29 
 
 		 511 aa  276  6e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0241134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4263  sporulation domain-containing protein  33.98 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353854  normal  0.0664789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0342  sporulation domain-containing protein  46.13 
 
 		 464 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3366  DamX domain-containing protein  48.58 
 
 		 512 aa  233  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0240  sporulation domain-containing protein  46.6 
 
 		 493 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000377836  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  26.36 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  27.47 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  26.85 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  29.36 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00508  DamX-related protein  25.18 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.512931  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5935  hypothetical protein  32.84 
 
 		 645 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212341  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>