65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2204 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  1003    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  56.13 
 
 		 504 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  55.47 
 
 		 497 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  39.38 
 
 		 505 aa  343  4e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3892  sporulation domain-containing protein  24.95 
 
 		 471 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.598853  normal  0.606435 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0249  sporulation domain-containing protein  25.77 
 
 		 464 aa  87  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.899829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3696  sporulation domain-containing protein  24.74 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  normal  0.829888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0288  DamX domain-containing protein  23 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0377  sporulation domain-containing protein  26.55 
 
 		 467 aa  82  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4263  sporulation domain-containing protein  25.36 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353854  normal  0.0664789 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0342  sporulation domain-containing protein  27.4 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4111  sporulation domain-containing protein  25.26 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4200  sporulation domain-containing protein  24.91 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4001  Sporulation domain protein  25.09 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.512353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4082  sporulation domain-containing protein  25.69 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0263  sporulation related  26.36 
 
 		 511 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0840788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4115  sporulation domain-containing protein  24.12 
 
 		 521 aa  71.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3366  DamX domain-containing protein  29.58 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3704  sporulation domain-containing protein  27.87 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16262  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0215  sporulation domain-containing protein  26.12 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0241134 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1527  hypothetical protein  33.72 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123632  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0650  sporulation and cell division repeat-containing protein  33.72 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000060629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3765  hypothetical protein  35.56 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00105538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0325  Sporulation domain protein  35.56 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133958  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03192  hypothetical protein  35.56 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.239022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0325  hypothetical protein  35.56 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00730739  normal  0.132997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3664  hypothetical protein  35.56 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00402866  normal  0.034061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3757  hypothetical protein  35.56 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3791  hypothetical protein  35.56 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0131119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4692  hypothetical protein  35.56 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.287594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3853  hypothetical protein  35.56 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3682  hypothetical protein  35.56 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3684  hypothetical protein  35.56 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000073089  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3858  hypothetical protein  35.56 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000274525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3584  hypothetical protein  35.56 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527215  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03240  hypothetical protein  35.56 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.213726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4603  hypothetical protein  33.73 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000306505  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0474  hypothetical protein  23.41 
 
 		 469 aa  54.3  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3032  Sporulation domain protein  28.24 
 
 		 506 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569801  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0266  Sporulation domain protein  30.23 
 
 		 616 aa  53.5  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.949989  normal  0.15172 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3964  hypothetical protein  32.53 
 
 		 329 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000242924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0227  hypothetical protein  32.53 
 
 		 329 aa  53.5  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3725  hypothetical protein  32.53 
 
 		 329 aa  53.5  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000388489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0240  sporulation domain-containing protein  23.78 
 
 		 493 aa  53.5  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000377836  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0165  sporulation domain-containing protein  30.11 
 
 		 311 aa  53.5  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.871522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3801  hypothetical protein  32.22 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  25.93 
 
 		 525 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4058  hypothetical protein  28.92 
 
 		 336 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000083596  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0640  putative lipoprotein, may be involved in cell division  31.25 
 
 		 185 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0255277  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0340  hypothetical protein  24.76 
 
 		 349 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3881  hypothetical protein  27.71 
 
 		 338 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.234173  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0965  hypothetical protein  24.51 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0996  hypothetical protein  26.83 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.62 
 
 		 616 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06425  hypothetical protein  25.53 
 
 		 118 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5125  hypothetical protein  32.18 
 
 		 541 aa  44.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.890867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0262  hypothetical protein  26.51 
 
 		 350 aa  44.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0410  hypothetical protein  32.18 
 
 		 540 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  25 
 
 		 271 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  29.67 
 
 		 550 aa  43.9  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1995  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  22.64 
 
 		 549 aa  43.9  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0549  sporulation domain-containing protein  29.76 
 
 		 533 aa  43.5  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.783944 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2047  type I secretion outer membrane protein  33.33 
 
 		 616 aa  43.5  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  27.46 
 
 		 274 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  28.41 
 
 		 548 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>