28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0377 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0377  sporulation domain-containing protein  100 
 
 		 467 aa  947    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4200  sporulation domain-containing protein  43.64 
 
 		 483 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0495455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4001  Sporulation domain protein  43.06 
 
 		 482 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.512353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4082  sporulation domain-containing protein  43.47 
 
 		 483 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4111  sporulation domain-containing protein  43.95 
 
 		 482 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.128924  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0288  DamX domain-containing protein  41.03 
 
 		 470 aa  350  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3704  sporulation domain-containing protein  44.72 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0263  sporulation related  42.97 
 
 		 511 aa  347  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0840788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3892  sporulation domain-containing protein  41.36 
 
 		 471 aa  342  9e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.598853  normal  0.606435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3696  sporulation domain-containing protein  41.49 
 
 		 471 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  normal  0.829888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0249  sporulation domain-containing protein  41.23 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.899829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0342  sporulation domain-containing protein  38.1 
 
 		 464 aa  310  4e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4263  sporulation domain-containing protein  39.26 
 
 		 483 aa  310  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353854  normal  0.0664789 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0240  sporulation domain-containing protein  37.35 
 
 		 493 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000377836  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0215  sporulation domain-containing protein  46.13 
 
 		 511 aa  262  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0241134 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3366  DamX domain-containing protein  50.19 
 
 		 512 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2204  hypothetical protein  21.6 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00510376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002329  DamX-related protein  20.78 
 
 		 504 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00026  hypothetical protein  21.03 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45230  hypothetical protein  34.21 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2724  putative cell division protein  30.56 
 
 		 505 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5774  hypothetical protein  26.07 
 
 		 548 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.785975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66580  hypothetical protein  26.85 
 
 		 551 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0412  hypothetical protein  27.41 
 
 		 533 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0974914  normal  0.234903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  26.59 
 
 		 271 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5935  hypothetical protein  37.7 
 
 		 645 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0389  sporulation domain-containing protein  26.96 
 
 		 526 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00508  DamX-related protein  27.48 
 
 		 503 aa  43.1  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.512931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>